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Schistosoma mansoni
cluster # 7589 cluster # 7589       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7589#0 length = 700 sequences # 5  

consensusID : consensus_7589#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 700
fasta sequence
                              [TTGTAACACAGTAAACTATAGTAATTTAAATAGAAAGCTATGTGTATTTTATTGAAGGATGTTTACGCAAAACTAGTGGAACAGTATGCAAACTATTGACAAAATTGAACAGTTCATATATACTATTGACTGACAAATGACTAGTTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAAGAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATTCTTATGATGAATTCGTTTCTTTAAACTTGAGTTATCAACTTGAATCATATCGTCTATACCCAGTCTTTTCTACTATCAATAATAGTGTTACTATTTCTACCGCTCGGGCATCTCACTGTACTATTGCTATAGTGAAGGAACTTGAACCGATGTACG]

[+] EMBL CD148393             [TTGTAACACAGTAAACTATAGTAATTTAAATAGAAAGCTATGTGTATTTTATTGAAGGATGTTTACGCAAAACTAGTGGAACAGTATGCAAACTATTGACAAAGTTGAACAGTTCATATATACTATTGACTGACAAATGACTAGTTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAGTACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAAGAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATTCTTATGATGAATTCGNTTCTTTAAACTTGAGTT                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD148350             [TTGTAACACAGTAAACTATAGTAATTTAAATAGAAAGCTATGTGTATTTTATTGAAGGATGTTTACGCAAAACTAGTGGAACAGTATGCAAACTATTGACAAAATTGAACAGTTCATATATACTATTGACTGACAAATGACTAGTTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTGAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAAGAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATTCTTATGATGAATTCGTTTCTTTAAACTTGA                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD148285             [TTGTAACACAGTAAACTATAGTAATTTAAATAGAAAGCTATGTGTATTTTATTGAAGGATGTTTACGCAAAACTAGTGGAACAGTATGCAAACTATTGACAAAATTGAACAGTTCATATATACTATTGACTGACAAATGACTAGTTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAGGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAACCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAAGAAAAACAATTATTAAATGAATTACATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATT                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD148310             [                                                                                                                                                TTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAATAGAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATTCTTATGATGAATTCGTTTCTTTAAACTTGAGTTATCAACTTGAATCATATCGTCTATACCCAGTCTTTTCTACTATCAATAATAGTGTTACTATTTCTACCGCTCGGGCATCTCACTGTACTATTGCTATAGTGAAGGAACTTGAACCGATGTACG]
[-] EMBL CD148321             [                                                                                                                                                 TGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACTTTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTATGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAAGAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTCCTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGACAAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATACAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCGAATTCTTATGATGAATTCGTTTCTTTAAACTTGAGTTATCAACTTGAATCATATCGTCTATACCCAGTCTTTTCTACTATCAATAATAGTGTTACTATTTCTACCGCTCGGGCATCTCACTGTACTATTGCTATAGTGAAGGAACTTGAACCGATGTACG]


>consensus_7589#0 TTGTAACACAGTAAACTATAGTAATTTAAATAGAAAGCTATGTGTATTTTATTGAAGGAT GTTTACGCAAAACTAGTGGAACAGTATGCAAACTATTGACAAAATTGAACAGTTCATATA TACTATTGACTGACAAATGACTAGTTGAATGTACTGCTTTACAGATGAAAGTTAAATACT TTCATCACTATGAAATTATCAACAGATTTGATAGTTTAGTATGAAAGACAATCTATTTTA TGACTGGTTTTAAATTGGTAGTTACCAATCCACTTGTGTTTTATTATTTTAACTAAAAAA GAAAAACAATTATTAAATGAATTATATTGGCGATCCTCCTTTTCAGGTATTGGTTTCTTC CTAGAGTGGGGTAATACAGAAAATGTAAATTAACTGGAATAAGACGATAAACTAAGTGAC AAAATATTTAGCATAAATAATCTTCTTTAATGGATTATATTATTGCAGAAATTTAAGATA CAATTATCCCATTAAATATTATTGTAGTTCGCATAGATTTATGCGTAATTTATTTGCTCG AATTCTTATGATGAATTCGTTTCTTTAAACTTGAGTTATCAACTTGAATCATATCGTCTA TACCCAGTCTTTTCTACTATCAATAATAGTGTTACTATTTCTACCGCTCGGGCATCTCAC TGTACTATTGCTATAGTGAAGGAACTTGAACCGATGTACG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)