These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7606#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 927 fasta sequence [GTATCATCTATATTACAAAAAAATGAATCTATTGAATTAAATAATGAAAATTATAATAATATAAAACAATTAGATAATAAACATGAACAAATGAAATTGAATTTTTTAATGAAATCAACTAATACTACTAATATTAATACTACTAATAATGGTAATGAACAATGTTTATTGAATCCATTAAAGAAAGAAATACAATCATCAAGTTTAATTGATCATAAAAATCAATTATGATCACCATCGTCAACACCA-CA-CCCCCCCACAGCAACAATAACAACAATTCATGATCTCCATTCCATTTCCACATAATAATGATAATAATATAGTGAATAATGTTTATTGAATCCATTAAAGAAAGAAATACAATCATCAAATTTAATCAATCATAAAAATCAATTGTGAGATTATCCAATTTATTTGATCCAT-TTGAACAACAACCAGTGATCACCACTACCACCATAGTAACAACAAGGACAACAACAATTCATGATCTCTATTCCATTTCACATACTAAAATTTACACTTTTAATGTAATATATAAATGAATTAAGAAATATGAAGCATTTATATTATTTATGTACTAAATGTATTCTGTATATATACATATGTATACCCGTCATAAAGGAGTATAGGCCATCAACCACTAAACTTTGTTCATGGACAATTCTTCCTAGTTACTATCGAATTTTACTAGAAGAACAAACATTTTGTACATAACTATCTATTTCTATCTTCTTGAATATCTCTAAATTATTTTGTGCTATGACCATTTGATCTTCATCTTTCTATTGGATTTATTTTTCTATGCATATTTAAGCAATATCAACAAAGATTTGGGCTTCCTTTATACAGATATCTCTTATTTATTTAGTTACTAGAGCTTATTGTACTTTATTTGA-GAAACGAAACAGAAACAACAACATAGATTCT] [-] EMBL CD112158 [GTATCATCTATATTACAAAAAAATGAATCTATTGAATTAAATAATGAAAATTATAATAATATAAAACAATTAGATAATAAACATGAACAAATGAAATTGAATTTTTTAATGAAATCAACTAATACTACTAATATTAATACTACTAATAATGGTAATGAACAATGTTTATTGAATCCATTAAAGAAAGAAATACAATCATCAAGTTTAATTGATCATAAAAATCAATTATGATCACCATCGTCAACACCA CACCCCCCCCACAGCAACAATAACAACAATTCATGATCTCCATTCCATTTCCACATAATAATGATAATAATATAGTGAATAATGTTTATTGAATCCATTAAAGAAAGAAATACAATCATCAAATTTAATCAATCATAAAAATCAATTGTGAGATTATCCAATTTATTTGATCCATGTTGAACAACAACCAGTGAT ] [+] EMBL CD113771 [ TCACCATCGTCAACACCAGCA CCCCCCCACGGCAACAATAACAACAATTCATGATCTCCATTCCATTTCCACATAATAATGATAATAATATAGTGAATAATGTTTATTGAATCCATTAAAGAAAGAAATACAATCATCAAATTTAATCAATCATAAAAATCAATTGTGAGATTATCCAATTTATTTGATCCAT TTGAACAACAACCA TTATCACCACTACCACCATAGTAACAACAAGGACAACAACAATTCATGATCTCTATTCCATTTCACATACTAAAATTTACACTTTTAATGTAATATATAAATGAATTAAGAAATATGAAGCATTTATATTATTTATGTACTAAATGTATTCTGTATATATACATATGTATACCCGTCATAAAGGAGTATAGGCCATCAACCACTAAACTTTGTTCATGGACAATTCTTCCTAGTTACTATCGAATTTTACTAGAAGAACAAACATTTTGTACA ] [-] EMBL CD113705 [ AACAACAAGGACAACAACGATTCATGATCTCTATTCCATTTCACATGCTAAAATTTACACTTTTAATGTAATATATAAATGAATTAAGAAATATGAAGCATTTATATTATTTATGTACTAAATGTATTCTGTATATATACATATGTATACCCGTCATAAAGGAGTATAGGCCATCAACCACTAAACTTTGTTCATGGACAATTCTTCCTAGTTACTATCGAATTTTACTAGAAGAACAAACATTTTGTACATAACTATCTATTTCTATCTTCTTGAATATCTCTAAATTATTTTGTGCTATGACCATTTGATCTTCATCTTTCTATTGGATTTATTTTTCTATGCATATTTAAGCAATATCAACAAAGATTTGGGCTTCCTTTATACAGATATCTCTTATTTATCTAGTTACTAGAGCTTATTGTACTTTATTCGACGACACGAAACAG ] [-] EMBL CD113871 [ gACTAAAATTTACACTTTTAATGTAATATATAAATGAATTAAGAAATATGAAGCATTTATATTATTTATGTACTAAATGTATTCTGTATATATACATATGTATACCCGTCATAAAGGAGTATAGGCCATCAACCACTAAACTTTGTTCATGGACCATTCTTCCTAGTTACTATCGAATTTTACTAGAAGAACCAACATTTTGTACATAACTATCTATTTCTATCTTCTTGAATATCTCTAAATTATTTTGTGCTATGACCATTTGATCTTCATCTTTCTATTGGATTTATTTTTCTATGCATATTTAAGCAATATCAACAAAGATTTGGGCTTCCTTTATACAGATATCTCTTATTTATTTAGTTAATAGAGCTTATTGTACTTTATTTGA GCACCGga ] [-] EMBL CD201955 [ TATATATACATATGTATACCCGTCATAAAGGAGTATAGGCCATCAACCACTAAACTTTGTTCATGGACAATTCTTCCTAGTTACTATCGAATTTTACTAGAAGAACAAACATTTTGTACATAACTATCTATTTCTATCTTCTTGAATATCTCTAAATTATTTTGTGCTATGACCATTTGATCTTCATCTTTCTATTGGATTTATTTTTCTATGCATATTTAAGCAATATCAACAAAGATTTGGGCTTCCTTTATACAGATATCTCTTATTTATTTAGTTACTAGAGCTTATTGTACTTTATTTGA GAAACAAAAAAAAAACAACAACATAGATTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||