These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7640#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1105 fasta sequence [CTGTCGAGGATCTTAATTAGGGTTGACGCCTATCCATTTCTGTTAGTAGACTCGCAAAATGACTCATTAGTTTATGGGTTACGCAATTTTCATGAAGTAAATCCTCTTTAAATCAATCATATGAACATTCATAAAACAAATACGATATAGTAAGCAAAGATGGATACGCACAGGTTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAAAAACATCAATGGGAAGATCCAAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTTTCCTTCAGCTATTGCACATACAGGACCTGTGCTAGGCCTCAAATTCTCATCAGATGGCTTACATTTAATTTCATGNNGGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATTGCATACTTTAACTTGTGTTGTTATTATCATTACTGAATATGAATCAGATCACCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD082076 [CTGTCGAGGATCTTAATTAGGGTTGACGCCTATCCATTTCTGTTAGTAGACTCGCAAAATGACTCATTAGTTTATGGGTTACGCAATTTTCATGAAGTAAATCCTCTTTAAATCAATCATATGAACATTCATAAAACAAATACGATATAGTAAGCAAAGATGGATACGCACAGGTTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAAAAACATCAATGGGAAGATCCAAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTTTCCTTCAGCTATTGCACATACAGGACCTGTGCTAGGCCTCAAATTCTCATCAGATGGCTTACATTTAATTTCATGNNGGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTANACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTNTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATT ] [+] EMBL CD146343 [ cAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTT ] [-] EMBL CD075691 [ TTAATTTCATG GGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATT ] [-] EMBL CD077097 [ TGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATT ] [-] EMBL AI395343 [ GTTATGTAATTNTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATTGCATACTTTAACTTGTGTTGTTATTATCATTACTGAATATGAATCAGATCACCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||