These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7660#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1058 fasta sequence [CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT] [+] EMBL CD083724 [CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCT ] [+] EMBL CD079134 [ TGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTG ] [-] EMBL CD196478 [ GCATTCCTGAGTCTGGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTA TTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCCGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATAT ] [-] EMBL AI976192 [ ATATATTCTTCCTCCNTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT] [-] EMBL AI975109 [ GCTTTTATTTATTTGTCCACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||