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Schistosoma mansoni
cluster # 7660 cluster # 7660       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7660#0 length = 1058 sequences # 5  

consensusID : consensus_7660#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1058
fasta sequence
                              [CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]

[+] EMBL CD083724             [CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD079134             [                                                                                                                                                                                                                                                     TGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTG                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD196478             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCATTCCTGAGTCTGGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTA TTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCCGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATAT                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AI976192             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATATATTCTTCCTCCNTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]
[-] EMBL AI975109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTTTTATTTATTTGTCCACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]


>consensus_7660#0 CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCA ATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAA ATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATA TTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACA GTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAA TTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCT CACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATG TTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCT GAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTC CCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTT TCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACA GTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGC TTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTG TATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAG GAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGT AACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAG TTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTT CCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)