These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7679#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 972 fasta sequence [CGACTGACCAAATTACATTACGAGCGCGTTGTGCAACACGTTCCAGATAATGTTTAGCAGAATTATGAGAATTAACAATAATTTTATGATTAATATCTTCTGTAGTTTTGGTGACACGATCAGATATTTGAGGTTTTGTAGAGTTTGATATTCCTACTGTTGGTGTTACTGGATATGATATAATAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACATAAACTAGCTAATCGTTGAACTAACGTAAATAAATTCGTGGAGACTAGAAGAGATGAAGATTGTGGTGGTAAAAGATTCCTTAAAGTGTTTCCACTAACTTTAGCATTATCATTATTACTGCTTCTGGAGTTAGATGAATTCATCGTGGTATTGTCATTATCTGAAACAGAACGTCTGGAAAAGCGTCTAGATGTCCAAAATTGTCGACTTAAAGGATTTAAACTACTGCTACTACTACTACCGCTAACTCCACAATCAGTATTTTTCGCAGAGACTTTTGAATTTTTCTTATTATTGCCCATTTCATTATTATAATTATCAATTT] [-] EMBL CD163894 [CGACTGACCAAATTACATTACGAGCGCGTTGTGCAACACGTTCCAGATAATGTTTAGCAGAATTATGAGAATTAACAATAATTTTATGATTAATATCTTCTGTAGTTTTGGTGACACGATCAGATATTTGAGGTTTTGTAGAGTTTGATATTCCTACTGTTGGTGTTACTGGATATGATATAATAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTCTGTGTAACCAACATCTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGG ] [+] EMBL CD129177 [ TAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT ] [+] EMBL CD129200 [ TAGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT ] [+] EMBL CD129201 [ AGTTGTAGTATGTGGTATAGATGAGCCAAGTGTACGTAAACGTTCGTAGAAACTCATAAAATCTAAATGAAAACGTTCAATCGCTTCGGAAAGACTTAAATTGGCATCAAATGGAACAGTTTGTGATAGCTGTCTGACAGGAGAATGATTAGATGTAGTTGATATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGGTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACAT ] [+] EMBL CD116883 [ ATTGCTGAACTACTATTAACAGCAGTAGGAGTAGTGGTTGGATTATATTCTGTTTGTGTAACCAACATTTGAATATTTGAACCAGGCACTGTAGGTGTATCATTGTCAGTTGGATATAAATTGACTTGAATTTCTGTATCTGCGACAACAAACGCTACAACTTGATCATCGTCTTCTTCATTAATTTCATTTGGTAGAGGAATAATTGTTGGTCCATTATTAACAACTACCTCAGCAGTAGTAGCAGCACGTCGACCACTTGGACGTTGTACAAGTGTATCCAGTGATTTCGGTTGACATAAACTAGCTAATCGTTGAACTAACGTAAATAAATTCGTGGAGACTAGAAGAGATGAAGATTGTGGTGGTAAAAGATTCCTTAAAGTGTTTCCACTAACTTTAGCATTATCATTATTACTGCTTCTGGAGTTAGATGAATTCATCGTGGTATTGTCATTATCTGAAACAGAACGTCTGGAAAAGCGTCTAGATGTCCAAAATTGTCGACTTAAAGGATTTAAACTACTGCTACTACTACTACCGCTAACTCCACAATCAGTATTTTTCGCAGAGACTTTTGAATTTTTCTTATTATTGCCCATTTCATTATTATAATTATCAATTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||