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Schistosoma mansoni
cluster # 7706 cluster # 7706       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7706#0 length = 1047 sequences # 5  

consensusID : consensus_7706#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1047
fasta sequence
                              [TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT]

[+] EMBL CD160093             [TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTGACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD116977             [                                                                                          GCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA         GCTTTGGATGGTGGTGACATTGGTATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD116676             [                                                                                           CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATGCGTCTAGCACACATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD116672             [                                                                                           CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA         GCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD155654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCCCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT]


>consensus_7706#0 TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCC TCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGG TCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACA ACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGT GGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTG TCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCAT CATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATT GATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGA ACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGT TTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACAT GAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATG ATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGAT CCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTA ATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTG TCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAAT GCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCA TCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCA TCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)