These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7721#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 734 fasta sequence [CATCTGGAGGACAGGCAGTAAACCCACCCTTAACAAACGTTCCTACTGGGAATGCTAGTTGTATGAATAATGGTGTACAAAACACATCTGGACTCACTTCTCCTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT-CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAGTATGGCTCGAGAAATTGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAACAGAATCATCACCTGAAAATGCAGTTGGCGTTGAACAAGATGATGTACAAAGCCAATCATGATGTTGTGGCTGCTTTGGTCAACGGTCGAAAGATCGACGTCTT] [+] EMBL CD117634 [CATCTGGAGGACAGGCAGTAAACCCACCCTTAACAAACGTTCCTACTGGGAATGCTAGTTGTATGAATAATGGTGTACAAAACACATCTGGACTCACTTCTCCTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAG ] [-] EMBL CD117181 [ ATCTGGACTCACTTCTCNTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATANNGTTGNCGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAGTATGGCTCGAGAAATTGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAAC ] [+] EMBL CD064436 [ TGGT ATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTA ] [-] EMBL CD197612 [ TAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTG ] [+] EMBL CD114332 [ GTACGAATGCTGGCGGCACACATATTGCGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCACAAGAAAGT TGGCTCGAGAAA TGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAACAGAATCATCACCTGAAAATGCAGTTGGCGTTGAACAAGATGATGTACAAAGCCAATCATGATGTTGTGGCTGCTTTGGTCAACGGTCGAAAGATCGACGTCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||