Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7804 cluster # 7804       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7804#0 length = 827 sequences # 5  

consensusID : consensus_7804#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 827
fasta sequence
                              [ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA]

[+] EMBL CD095364             [ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD145447             [                                                        GTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTTGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGTAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD188549             [                                                                                 TTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD202212             [                                                                                                                                               GAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD066584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAAAACGAAATACAACCATATCTCTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA]


>consensus_7804#0 ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGG CAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGAT GATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATA AATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAG TAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCA ACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCAT ATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTT CCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGT ACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTA AACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAA CCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAA TAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAA CTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAAT TCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)