These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7804#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 827 fasta sequence [ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA] [+] EMBL CD095364 [ATGAACTTGTCGATGATAATATTCGTTACAATTTGGCTGATCCGTTGTTGGACACAGTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCTTAACAGTACCAACAGCTTTTGTTTTACCTTCACGAAATATTAAACGTAGACCAGTGTACAAATATTCAGGAGATTTAATAAAACGAAATACAACCATATCTTTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTG ] [+] EMBL CD145447 [ GTGGCAGCGCACTGGGAGTTGAATTTTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTTGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGTAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCC ] [-] EMBL CD188549 [ TTTGTCGCATTTATTCAGTAATATCTTTACGTGTACGATGATAATGATGTTTCCGTTGTCGTGAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTA ] [-] EMBL CD202212 [ GAATTAGCTGGGGCATTAATATTATTACTAGTTAATAAATCAGAAACAGGAATATTAGACAATTCAGTAGTATCTGGTTGACTAGTAGTATTAGTAGTAGTAGTAGTACTGATATACTCGGCAGATTTAGGGATTGATGACGTATTACTTAAATTCAACGTCTTTATCTCGTCCGTTACAGTATTATTCATCGGTTGGTTTGTCTTACTAGTAGCATATCTTTTATATAGTTTAGCACGTGGATTTTGTTGAATTGAAGCAGAATACGGAACTAGTTCCT ] [+] EMBL CD066584 [ ATAAAACGAAATACAACCATATCTCTATCACCAGTTCGTAAACGTTCATGTGAATTTAATTTTAATATTGTTGCAGTTTGACGTACAGGACCAGCATGAACCATAGCTTGATAACCAACTGATATAGTTGTAGGATGATGTAAAATTAATACTTCAGCAATAAATTCAATACATGCTTTTGGTTTAGATTCTGGTGCTAACAATACCATACCTTTACGAACTTGATTACGTCGAAGTTTTTTCAATGCAAATGATGCAGTTTGTCCACCACGTACATAATTCACTGATAAACGTTTACGTTGTATACTTTTAATTGATATCGGATTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||