These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7809#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 395 fasta sequence [AACTTTATATTCAATGAATTA-GTACAA-GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGAATGAACACTTCAGGT] [+] EMBL CD134536 [AACTTTATATTCAATGAATTACGTACAACGTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCca ] [+] EMBL CD134534 [AACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAGATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGT ] [+] EMBL CD134485 [ ACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATAGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGAATGAACACTTCAGGT] [+] EMBL CD134538 [ ACTTTATATTCGATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAGCAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAGGTCCGATACCAATTCATAAGGGGA ] [+] EMBL CD134515 [ ACTTTATATTCAATGAATTA GTACAA GTGTAATTAATATAGTTAGTAATAAACGAAATTTATCCTACCTAAAGTGGTTAAATATAGGAAAGATGTTTTGATGATATTATGTTCGTCAGGACTTAGCATCCTATGAAGAGGCCGAATCAAAGAACTGGCAATGTAGATGGTTTATAGCTGAGCTATTGGATGCATCGATTCCATGCAGTCGACACATAAACTAACAATGACCACAGATAACTACAACCTTAATAATCCTCAGTAGCATGATCGTATTGAGGAATTAATGGTTTGGATAGGTTTCAGGATTATTTCACTGGTCCCACAGAGACCTCAGTGGAATCAGTTGCAGTTAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||