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Schistosoma mansoni
cluster # 7810 cluster # 7810       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7810#0 length = 1138 sequences # 5  

consensusID : consensus_7810#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1138
fasta sequence
                              [CCTGTGAAAGATGGAAATTCTTTCTTTGTGGTATGGCAATATATTATTATATCAGATTGTGATTCTCCAGTTCGTGGTCTACCAACTATTCCACCAACCTATTTAGGTCCAGTTTCACGTTTTGATTCAATGGGTTTAAAAGCTCTAAGTCATACAGATCCATTCATTCAAGCTAATACTGGTGAATTGTGTATTCAATTTGCTCGGCATCCTGACAAACCTTTACGAATTATGGCACAATTAATACACTGTAGTCATGATGTATCGGAAGATTGTTCACAACAAATTCTTCAACAAACACGTGATTTTCAAATCTACTTTGTTATACGTTTCCCCCATCCAGGATTTTTCAAATTTCAAATATATGCTCTTCCTTATACGGAACCAGGCGAATCACTTCCTAGTGTTTATAATTATCTCTTGGAAGCAACTCAGGTTAATCGTGGAAGAAACGGTCATGTAATGTGTTTTCCACAACAATTTGCTCAATGGAAAGAAGGCTGCTATCTTCATACACCAATGGATGGTATATTATATCCTAGTGTATCAAATCAACCAACTGCTGATACTGTACCGTTTCGTGTCACTATACCAACTGCACATGCAGTTGCTGTTGTTGTCGGTGAAGATTGGACACATTTAAGCAAAGTTAATGATTGTTGGACTGGTCAAGTTTGTCTAAAACCGTATTGGGGCATAGAAAACCAATTAGCATTATGTGCTAAGTATAATGTTGACGATGGAAACTATGGTACTTTATTAGAATATCGATTAGCTAAACGGTAAACAAAAACAAATAGATAGATGAAAGATAAAAGGATTAGATTCTACTAAACAAACTTTGTTATGATAAATATAATCTCACGTTGTTTACAACTCATTCCTTGTTCCCACATTCGTCTAACTATTCTAATCAGTCTGACTCAAAGTTTAATTGAAATGTGTTTCATCCAAATTTGTGTGCGTTTGTGTTTTAGAGGCTGATAATTGGTTCATTCCTTTTGCATCCCAACCAAACCTCATGTTTGATCGAAATGAAATTTGTGCATATTGATTTGTTATGTATATGTGTGTATATCCTTATTATATTTATATTCTGCTTACTCTAGAAGTATGTATACACATATACTTATCTGCC]

[+] EMBL CD067895             [CCTGTGAAAGATGGAAATTCTTTCTTTGTGGTATGGCAATATATTATTATATCAGATTGTGATTCTCCAGTTCGTGGTCTACCAACTATTCCACCAACCTATTTAGGTCCAGTTTCACGTTTTGATTCAATGGGTTTAAAAGCTCTAAGTCATACAGATCCATTCATTCAAGCTAATACTGGTGAATTGTGTATTCAATTTGCTCGGCATCCTGACAAACCTTTACGAATTATGGCACAATTAATACACTGTAGTCATGATGTATCGGAAGATTGTTCACAACAAATTCTTCAACAAACACGTGATTTTCAAATCTACTTTGTTATACGTTTCCCCCATCCAGGATTTTTCAAATTTCAAATATATGCTCTTCCTTATACGGAACCAGGCGAATCACTTCCTAGTGTTTATAATTATCTCTTGGAAGCAACTCAGGTTAATCGTGGAAGAAACGGTCATGTAATGTGTTTTCCACAACAATTTGCTCAATGGAAAGAAGGCTGCTATCTTCATACACCAATGGATGGTATATTATATCCTAGTGTATCAAATCAACCAACTGCTGATACTGTACCGTTTCGTGTCACTATACCAACTGCACATGCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD178143             [                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGTATCGGAAGATTGTTCACAACAAATTCTTCAACAAACACGTGATTTTCAAATCTACTTTGTTATACGTTTCCCCCATCCAGGATTTTTCAAATTTCAAATATATGCTCTTCCTTATACGGAACCAGGCGAATCACTTCCTAGTGTTTATAATTATCTCTTGGAAGCAACTCAGGTTAATCGTGGAAGAAACGGTCATGTAATGTGTTTTCCACAACAATTTGCTCAATGGAAAGAAGGCTGCTATCTTCATACACCAATGGATGGTATATTATATCCTAGTGTATCAAATCAACCAACTGCTGATACTGTACCGTTTCGTGTCACTATACCAACTGCACATGCAGTTGCTGTTGTTGTCGGTGAAGATTGGACACATTTAAGCAAAGTTAATGATTGTTGGACTGGTCAAGTTTGTCTAAAACCGTATTGGGGCATAGAAAACCAATTAGCATTATGTGCTAAGTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD071413             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGAAGCAACTCAGGTTAATCGTGGAAGAAACGGTCATGTAATGTGTTTTCCACAACAATTTGCTCAATGGAAAGAAGGCTGCTATCTTCATACACCAATGGATGGTATATTATATCCTAGTGTATCAAATCAACCAACTGCTGATACTGCACCGTTTCGTGTCACTATACCAACTGCACATGCAGTTGCTGTTGTTGTCGGTGAAGATTGGACACATTTAAGCAAAGGTAATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD066612             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCAAAGTTAATGATTGTTGGACTGGTCAAGTTTGTCTAAAACCGTATTGGGGCATAGAAAACCAATTAGCATTATGTGCTAAGTATAATGTTGACGATGGAAACTATGGTACTTTATTAGAATATCGATTAGCTAAACGGTAAACAAAAACAAATAGATAGATGAAAGATAAAAGGATTAGATTCTACTAAACAAACTTTGTTATGATAAATATAATCTCACGTTGTTTACAACTCATTCCTTGTTCCCACATTCGTCTAACTATTCTAATCAGTCTGACTCAAAGTTTAATTGAAATGTGTTTCATCCAAATTTGTGTGCGTTTGTGTTTTAGAGGCTGATAATTGGTTCATTCCTTTTGCATCCCAACCAAACC                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD072147             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GATGAAGGATAAAAGGATTAGATTCTACTAAACAAACTTTGTTATGATAAATATAATCTCACGTTGTTTACAACTCATTCCTTGTTCCCACATTCGTCTAACTATTCTAATCAGTCTGACTCAAAGTTTAATTGAAATGTGTTTCATCCAAATTTGTGTGCGTTTGTGCTTTAGAGGCTGATAATTGGTTCATTCCTTTTGCATCCCACACTTTGATCATGTTTGATCGAAATGAAATTTGTGCATATTGATTTGTTATGTATATGTGTGTATATCCTTATTATATTTATATTCTGCTTACTCTAGAAGTATGTATACACATATACTTATCTGCC]


>consensus_7810#0 CCTGTGAAAGATGGAAATTCTTTCTTTGTGGTATGGCAATATATTATTATATCAGATTGT GATTCTCCAGTTCGTGGTCTACCAACTATTCCACCAACCTATTTAGGTCCAGTTTCACGT TTTGATTCAATGGGTTTAAAAGCTCTAAGTCATACAGATCCATTCATTCAAGCTAATACT GGTGAATTGTGTATTCAATTTGCTCGGCATCCTGACAAACCTTTACGAATTATGGCACAA TTAATACACTGTAGTCATGATGTATCGGAAGATTGTTCACAACAAATTCTTCAACAAACA CGTGATTTTCAAATCTACTTTGTTATACGTTTCCCCCATCCAGGATTTTTCAAATTTCAA ATATATGCTCTTCCTTATACGGAACCAGGCGAATCACTTCCTAGTGTTTATAATTATCTC TTGGAAGCAACTCAGGTTAATCGTGGAAGAAACGGTCATGTAATGTGTTTTCCACAACAA TTTGCTCAATGGAAAGAAGGCTGCTATCTTCATACACCAATGGATGGTATATTATATCCT AGTGTATCAAATCAACCAACTGCTGATACTGTACCGTTTCGTGTCACTATACCAACTGCA CATGCAGTTGCTGTTGTTGTCGGTGAAGATTGGACACATTTAAGCAAAGTTAATGATTGT TGGACTGGTCAAGTTTGTCTAAAACCGTATTGGGGCATAGAAAACCAATTAGCATTATGT GCTAAGTATAATGTTGACGATGGAAACTATGGTACTTTATTAGAATATCGATTAGCTAAA CGGTAAACAAAAACAAATAGATAGATGAAAGATAAAAGGATTAGATTCTACTAAACAAAC TTTGTTATGATAAATATAATCTCACGTTGTTTACAACTCATTCCTTGTTCCCACATTCGT CTAACTATTCTAATCAGTCTGACTCAAAGTTTAATTGAAATGTGTTTCATCCAAATTTGT GTGCGTTTGTGTTTTAGAGGCTGATAATTGGTTCATTCCTTTTGCATCCCAACCAAACCT CATGTTTGATCGAAATGAAATTTGTGCATATTGATTTGTTATGTATATGTGTGTATATCC TTATTATATTTATATTCTGCTTACTCTAGAAGTATGTATACACATATACTTATCTGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)