These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7853#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 510 fasta sequence [TCATTGACTTGGATAGTACATTATGGTCAATCCAAACAATGGATGGTTATGCGGAAATTCAAAGACTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTGTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTAATAATAATGAGCATATGTTATTGA] [+] EMBL CD152108 [TCATTGACTTGGATAGTACATTATGGTCAATCCAAACAATGGATGGTTATGCGGAAATTCAAAGACTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTGTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAGATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTAATAATAATGAGCATATGTTATTGA] [-] EMBL CD152159 [ TCAATTCAAACAATGTATGCTTATGCGGAAATTCAAAGATTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTTTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTC TTAATCAGGATGAGCATA ] [-] EMBL CD152060 [ ATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCCATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCgc ] [-] EMBL CD151986 [ AATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCCATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACAACGGATg ] [-] EMBL CD151977 [ CACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTCACAATAATCAGC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||