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Schistosoma mansoni
cluster # 7853 cluster # 7853       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7853#0 length = 510 sequences # 5  

consensusID : consensus_7853#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 510
fasta sequence
                              [TCATTGACTTGGATAGTACATTATGGTCAATCCAAACAATGGATGGTTATGCGGAAATTCAAAGACTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTGTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTAATAATAATGAGCATATGTTATTGA]

[+] EMBL CD152108             [TCATTGACTTGGATAGTACATTATGGTCAATCCAAACAATGGATGGTTATGCGGAAATTCAAAGACTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTGTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAGATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTAATAATAATGAGCATATGTTATTGA]
[-] EMBL CD152159             [                          TCAATTCAAACAATGTATGCTTATGCGGAAATTCAAAGATTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTCATATGAATCAGTGTGGTTTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTC TTAATCAGGATGAGCATA         ]
[-] EMBL CD152060             [                                                                                                                                                                                  ATTTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCCATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCgc                                       ]
[-] EMBL CD151986             [                                                                                                                                                                                                  AATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCCATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACAACGGATg                                  ]
[-] EMBL CD151977             [                                                                                                                                                                                                              CACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAAGTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGATCAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCATCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAAACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTTTCTTTCACAATAATCAGC            ]


>consensus_7853#0 TCATTGACTTGGATAGTACATTATGGTCAATCCAAACAATGGATGGTTATGCGGAAATTC AAAGACTTAAAACAGACCATATCGTTGTTGAAATGTCTACTTTGCATCATGAACCAGTTC ATATGAATCAGTGTGGTGTTGTAGCACTATTGTCCAATGGTGAAGTGGTCATTATTCCAT TTCAACGTACAGACAATGAACTCGTACACCTTCGTGTTCGAGATAATTGTAATCTATCAA GTCATTGGTGCAGTTCAATATGTACATATCAGGATGGTATACTTGTAGCACATGATGGAT CAGCTTTATTTCATCCATTTGATGATAGTACACATGTATTCACACCACTTCCGGGATCCA TCAATAATTTGGAAAATATCCATATTGACAGAATTGAACCACTTTGTTTACCTAATGGAA ACAGTTTCAAGTTACTTTATATTGTAACAAGCAAATTAGAATCTGAACCACGGATTATTT TCTTTAATAATAATGAGCATATGTTATTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)