These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7854#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1092 fasta sequence [TTATACTGTTTGGTATCATCGTTCTTGGGTTATGAATAATCACACTTCTCCAAATTGGGAATCTGAATTAAAGCTTTGTAACCAAGCGTTAACACAAGATGAAAGAAATTTCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTTTAGCTTCCACATCTAATGTTTCCTCTGTATCATCATCTGAAAGCCCTAATCTTCAAATCCAGTTGGATAAAAAACAAAGCCAATCTCGATTTGACTTTTCAGTACCAAATGGCGAACTGGATCTTGTTCACAATGCAATATTTACAGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG-AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG-AGTTGCA-GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG-ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCANAATGAATCATTGACACGTGTCACTCTAGACCCTCTAAGATTGTTAAATCCTATGATTTTGCCCTCACATAATCCAAAAGATTTGGTTGGGGAACTGAACATTGTTCGTGACCTGCTGTCATTTGAACCGAAAAACATATGGGCTTTGTTGACGCTTGTCAGTCTCCTTCCGTTTATTCGACCGCATAGTTTTCATGAAGACGTCAACGAAGCGTCAATTGTGTTATG] [+] EMBL CD116897 [TTATACTGTTTGGTATCATCGTTCTTGGGTTATGAATAATCACACTTCTCCAAATTGGGAATCTGAATTAAAGCTTTGTAACCAAGCGTTAACACAAGATGAAAGAAATTTCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTT ] [-] EMBL CD160653 [ TCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTTTAGCTTCCACATCTAATGTTTCCTCTGTATCATCATCTGAAAGCCCTAATCTTCAAATCCAGTTGGATAAAAAACAAAGCCAATCTCGATTTGACTTTTCAGTACCAAATGGCGAACTGGATCTTGTTCACAATGCAATATTTACAGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTA ] [+] EMBL CD082963 [ AGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCANAATGAATCATTGACACGTGTCACTCT ] [+] EMBL CD152945 [ CTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAGAAAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAGAATTTAGTATCTC ] [+] EMBL CD185735 [ TTTAAAAGAAGTTGCAGGGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTCGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCAAAATGAATCATTGACACGTGTCACTCTAGACCCTCTAAGATTGTTAAATCCTATGATTTTGCCCTCACATAATCCAAAAGATTTGGTTGGGGAACTGAACATTGTTCGTGACCTGCTGTCATTTGAACCGAAAAACATATGGGCTTTGTTGACGCTTGTCAGTCTCCTTCCGTTTATTCGACCGCATAGTTTTCATGAAGACGTCAACGAAGCGTCAATTGTGTTATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||