These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7886#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1235 fasta sequence [TTTGAACAGACAATTTCTGTTCCGATCTCACGATGTCGGTAAACCGAAAGCCAATGTTGCTGCTGATTTTATCATGCGCCGCATTCCAACATGCAAGGTCGTCCCACATTACAATAAAATTCAAGATTTCGGTGCGCCATTTTATAAACAATTTAATGCTGTGGTTTGTGGTCTTGATTCAGTCACAGCTCGACGGTGGTAACTCTATGCTGGCAAGTCTAGTTCGTTATAATCCAGATGGTCAACCAGATCCAAACACTGTCATACCACTTGTTGATGGTGGGACAGAGGGATTCAAAGGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTACAAATGCTGTTATCGCAGCTGCATGTGCAACTGAGGTCTTCAAACTAATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATTTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTTGT] [+] EMBL CD080499 [TTTGAACAGACAATTTCTGTTCCGATCTCACGATGTCGGTAAACCGAAAGCCAATGTTGCTGCTGATTTTATCATGCGCCGCATTCCAACATGCAAGGTCGTCCCACATTACAATAAAATTCAAGATTTCGGTGCGCCATTTTATAAACAATTTAATGCTGTGGTTTGTGGTCTTGATTCAGTCACAGCTCGACGGTGGTAACTCTATGCTGGCAAGTCTAGTTCGTTATAATCCAGATGGTCAACCAGATCCAAACACTGTCATACCACTTGTTGATGGTGGGACAGAGGGATTCAAAGGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTA ] [+] EMBL CD078552 [ GGACATGTCCTCGTTGTTCTGTATGGCCTAACTGGATGCCTAGAATGTACACTTGACCTATACCCTCCACCAACCAATTTTCCCTTATGTACTATAGCGCATACTCCTCGCCTTCCAGAACATTGCATAGAATATGTAAGAATACTGTTGTGGTCAAAAGACAATCCATTTGGAGATAATGTTGCAATCGACGGTGATTCACCTGAACACATACAATGGATATATGAAAAGTCATGTGAAAGGGCTAAACAATTCGGAATTTCAGGTGTTACACTACGTCTTGTACAAGGTGTTGTAAAGCGAATAATCCCTGCTGTCGCTTCTACAAATGCTGTTATCGCAGCTGCATGTGCAACTGAGGTCTTCAAACTAATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTNTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCAC ] [-] EMBL CD074409 [ AATCACATTCTGTTACAATTATTTGGATAATTACATGAATTTCAGTGATATTGATGGAGTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTTTTTGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATTTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATTTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTTTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATTTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTTTGAATTAATTTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTTTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTT ] [-] EMBL CD073019 [ GTTTATACCTATGGTTTTTCTGTTGAACGCAAAGCTGATTGTCTTGCCTGTAACAATGTGCCTCGAACTCTTCGTTTGCAGACTGGTTGTACACTAAGAGATCTTATAAATGTTTTGAAGACAGATCCTGAATTTCAAATGCAGTCACCCAGTATAACAACAATTATTGATGATCAACATCGTTCATTGTATATCAATCTTCCAGAATTGGTTGATACATTGAAACCGAATTTGTTTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAGCTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATAATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTTGT] [-] EMBL AI764901 [ CATTGAAACCGGAATTGTCTAAAACCCTTCAAGAACTTGGTCTTATTAATGGTCAAATCATTCATGTTAGTGATATTACAACACCTAGAACATTATCTATAAAACTTCAATTGGATGATAAGTAATAATGCAAATAATTTGGTCGCTCTGAATTAATCTCATTGAAGCCAACTATTTATTGATGATAACATGATTATTATATTATAAAATGTATTATTATTATTATCATTATTATTTCTTGTATCTTTGTGATATGGTTATTTTAGTTGTCATAGTAAATATAACGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||