These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7909#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 834 fasta sequence [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA-ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT] [+] EMBL CD152408 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTNTGAGCCACAACCCATTTGC ] [+] EMBL CD152382 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAATTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTT ] [+] EMBL CD152403 [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGCTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGCAATTCTATGGTGAACAACCACACTGATAATGGCTAGGGTGTGACACTACCGAGTCACCGGCGTTGTGGACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTA ] [-] EMBL CD152450 [ TTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCTGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT] [-] EMBL CD152407 [ TTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGTTATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATCAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||