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Schistosoma mansoni
cluster # 7909 cluster # 7909       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7909#0 length = 834 sequences # 5  

consensusID : consensus_7909#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 834
fasta sequence
                              [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA-ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]

[+] EMBL CD152408             [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTNTGAGCCACAACCCATTTGC                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD152382             [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGA ACTGATAATGGTAAAGGTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTACCAGGTAGTGTAATTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD152403             [AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGCTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATGTTATGAATGCAGAAGAATCACTGCAATTCTATGGTGAACAACCACACTGATAATGGCTAGGGTGTGACACTACCGAGTCACCGGCGTTGTGGACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATAATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGTATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD152450             [                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCTGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]
[-] EMBL CD152407             [                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTTTACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTTACCTCTCTTATGTAATGGTTATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATATTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAGTATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATTACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATACCTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATTAAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATCAGAAAACTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCACTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT]


>consensus_7909#0 AAGCTGGAAAGGGGAGAACTGGTGTTATGGTCTGTGCATGTCTTCTTCGACTACACGATG TTATGAATGCAGAAGAATCACTGAAATTCTATGGTGAACAACGAACTGATAATGGTAAAG GTGTAACAATACCGAGTCAACGGCGTTATGTACATTATTATGATTTATTCTTAAAAAATA ATCTACAATATCATAGAATTCCTCTTTTCTTAACAGCTGTACGTGTTTGTGGATTACAGT ATTTACCAGGTAGTGTAACTTTTTTCTCTCCACCAATTATTTCAGTCACTTCAACTTTTT TACCATGGCTTAAACTCGTAACATTTCCCTATCTATGCACTACATCATACCCGTATGCTT ACCTCTCTTATGTAATGGATATTGCAGTTCTAGTGACTACTGATCGAAAACACACATATA TTTTATTATTCATACAGTAAACTGTAGCCTTTCATCCTGCTTTCTGACGTGTTGTATGAG TATATAATACATAACATCGACGATTACTTATCAGTTTTGATTGTAATTCGATTATGAATT ACATATCTATACACTCGACTTTGAGCCACAACCCATTTGCATGAATGTTAGTAATAATAC CTGGGTACTCAAACTGAAGTAGGTGCAGGGGAGCGTTTCGAACCAGAGCGCTTTGTGATT AAAATGTAGTTGATCAAATCACTAGTCCATGGTGCCACATTTTGTTCTTAGATTAGAAAA CTGAGAATACGAAGCAATGTAGTTTGCAGTGCAGTTTTCCTTATGTTTTTACCATAGTCA CTAAACCATTTAACCACCAATAAATTCGAATGTTTTTTTCTTATGTAACTTTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)