These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7920#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 717 fasta sequence [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG-TTTGTTA-TTTTGTTATGATAATTTATATTAG-TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT-AATGTG-TTTTTCGATTATTGAGAAGA-CCCACCTAATAA-CC-CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA--GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAATGGTGGGGGTTTCGTATCAATTATACTTTCCCTATAT] [+] EMBL CD202082 [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTCCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGGTTTTGTTATTTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATANTTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTGTTTTTTCGATTATTGAGAAGACCCCACCTAATTA CC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAACAATATATGATCTATGGTG GGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGGAATGGTGGGGGTTTCGGATCAATTATACTTTTCCTAT ] [+] EMBL CD202083 [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAAAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATTATTTTTCGTACTGATCACGAAGTAAATGTG TTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCT ATAA CCNCGAATCATAACANATACTTCACTANTAATCTACTTAATCGTTAACATACTTCAAAATTATATGATCTA GTGTGGGGTTGTTACCACTTATTCACCAGTAATGTTGGCGG TTCGTATC ATTATACTTTCt ] [+] EMBL CD201972 [GACTTTGGGAAAATGACACAAAACCCCAGAAGTTTCCCCAGGTCCGTGGAAAGTCCCCAAAATGTTTGGGGAAATTTACGGTTTTCCCCAATATTTCCCCAGAATCTTATAACAATTTGAGGGTTTTACCGAAGATAGGGAGATTGGGTCTCGGTGTGGAAACTGCATTTTCAGTCAGCCGATTTCGGGGACACCAAATGATACCAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAGGTTTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA CCACCTTATAA CC CCGATCATAAC AATACTTTACTAT AATCTACATAATCGTT ACATACTCC AAATTATATGATCTA GTGTGGGTTTG TAACACTTATTC CCAGTAATGGTGGGG TTCGGATCAATTATACTTnct ] [-] EMBL CD202122 [ CAGGAATTTCTGTCAGAACCTACAGCGAAACCGTGGAGATGCATAAACAAGATTGCAAGTNTAAATCAAGTTATCTCCAACTATGTAGAGGACTCGTAACTTTTTCCAAATCAGTCGGTCCTTATCAGTCTAATCCTCCTAAAAAACCACTCCCCTTGAAGTCTTATATCAGTTGAATTAAGGATCCTCCATCATATTCACTTCTCAACGTTGTCCTGAACTAAATATGTTAAACAGATCAGTTACCTCGGG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGNAAAGA CCCCCGTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTTCACTATAT] [-] EMBL CD072143 [ ATCATATTCACTTCTCANCGTTGTCCTGAACTANATATGTTAAACAGATCAGTTACCT GG TTTGTTA TTTTGTTATGATAATTTATATTAG TTCTAACAAGCTTAGTTGTGAAGACCTATAATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTT CCTATA ] [-] EMBL CD072156 [ GATAA TTATATTAGTTTCTACNAAGCTTAGTTGTGAAGACCTAT ATTTTTCGTACTGATCACGAAGT AATGTG TTTTTCGATTATTGAGAAGA CCCACCTAATAACCC CGAATCATAACAAATACTTCACTATAAATCTACATAATCGTTAACATACTCCAAAATTATATGATCTA GTGTGGGTTTGTTACCACTTATTCACCAGTAAT GTTGGTGTTTCGTATCAATTATACTTT CCTATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||