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Schistosoma mansoni
cluster # 8021 cluster # 8021       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8021#0 length = 1013 sequences # 6  

consensusID : consensus_8021#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1013
fasta sequence
                              [TGATATTAGTAACAGAGGTGGAGTTCAGAATCGAACACCACAAAAACAGAGATACAGAAGGTTGTATCATCCTTGTAAAAAAAAAGACGACCAGTGAGTAAATAAAATAAGTTCTGAATAAGTTATCTTAAGGTAATACAATAAGAAAGGATGGGATTGATAAAAATTCATAACAGATAAATTTCGAGGTTCATTCAAGCTGCCTTCAAATTTCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAAATATGCCTGAACAAATTAAAATTAATTCATTAACTCGTATGCGCATCAAAAACTAGAAGTTATTGGGTTAGTACTATTTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTCAACATATTGTCGTAGATCTCTGTATGTACGATCAGTAGATCGAGTCTGTGTTGGATTTGAAGTAAAAGCTGACGATGGTGACGATGATTGTTGTGTTGCATAA-TTTGTTACAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTACACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCTAAACCAAGAGAATGACGCCAAGAACCGGAAGATGAACCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACAATTTAAAAATGGAAGTTTCCCATCATTTGTTGAATGC]

[-] EMBL CD118666             [TGATATTAGTAACAGAGGTGGAGTTCAGAATCGAACACCACAAAAACAGAGATACAGAAGGTTGTATCATCCTTGTAAAAAAAAAGACGACCAGTGAGTAAATAAAATAAGTTCTGAATAAGTTATCTTAAGGTAATACAATAAGAAAGGATGGGATTGATAAAAATTCATAACAGATAAATTTCGAGGTTCATTCAAGCTGCCTTCAAATTTCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD194679             [                                                                                                                                                                                                                    TCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGTAACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTTCTTAGAAATATGCCTGAACAAATTAAAATTAATTCATTAACTCGTATGCGCATCAAAAACTAGAAGTTATTGGGTTAGTACTATTTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD185843             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTTAGTACTATTTGACGTGNTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD117171             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAGCTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAGGTTCAACATATTGTCGTAGATCTCTGTATGTACGATCAGTAGATCGAGTCTGTGTTGGATTTGAAGTAAAAGCTGACGATGGTGACGATGATTGTTGTGTTGCATAA TTTGTTACAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTACACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCT                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD069119             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgTAACTCTGTGAGAGAAGAACGGTCAACTCGTCCTAAATTGCACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAACTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATACCGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATCTGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTGGATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCTAAACCAAGAGAATGACGCCAAGAACCGGAAGATGAACCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACAATTTAAA                              ]
[-] EMBL CD090268             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAGTTGAATTACCGGAACGATTTAAAAATGGAAGTTTCCCATCATTTGTTGAATGC]


>consensus_8021#0 TGATATTAGTAACAGAGGTGGAGTTCAGAATCGAACACCACAAAAACAGAGATACAGAAG GTTGTATCATCCTTGTAAAAAAAAAGACGACCAGTGAGTAAATAAAATAAGTTCTGAATA AGTTATCTTAAGGTAATACAATAAGAAAGGATGGGATTGATAAAAATTCATAACAGATAA ATTTCGAGGTTCATTCAAGCTGCCTTCAAATTTCGTTGGAAAAAAAATATATATGTATGT AACATTAAGTAACAATTATTCCATATGAATTCTAAGCAATCAAATAGATGAGATGTTCTT CTTAGAAATATGCCTGAACAAATTAAAATTAATTCATTAACTCGTATGCGCATCAAAAAC TAGAAGTTATTGGGTTAGTACTATTTGACGTTGTAGCGGTGCTTCCTACAATTCGATCAG CTAGTTCTAGACTCAATTCTAATTCCAGTGGTTCACAATCATCATCGTAAGATGAATAAG GTTCAACATATTGTCGTAGATCTCTGTATGTACGATCAGTAGATCGAGTCTGTGTTGGAT TTGAAGTAAAAGCTGACGATGGTGACGATGATTGTTGTGTTGCATAATTTGTTACAGAAG AACGGTCAACTCGTCCTAAATTACACAACTGTTCAGATATAAAATTTTCACTTTGGCTAA CTTGTTTCGTTTGAGTTTGTTGTTGCAGGAACGATGATTCAATATTATGATCAGACATAC CGAATAGTGTCGTTTGAGGAAAATACATAAGATCAGGTGGTGTTACTGGACCTAAGCATC TGTTCGCATTCTCATGACCACTATTTCCTGAACAAGAAGATGTGGATAAGGATGTAATTG GATCTCCTCGTTGTAAGCTATGTGAATCACTTAACAAACGCATATCTAAACCAAGAGAAT GACGCCAAGAACCGGAAGATGAACCGACAGAATTATTTATAGATGGTGATAGAGATGTAG TTGAATTACCGGAACAATTTAAAAATGGAAGTTTCCCATCATTTGTTGAATGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)