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Schistosoma mansoni
cluster # 8149 cluster # 8149       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8149#0 length = 908 sequences # 6  

consensusID : consensus_8149#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 908
fasta sequence
                              [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG]

[+] EMBL CD097896             [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGACGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD097796             [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTACGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAANCGCAACATGTATGTAAGAGAATATAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD098151             [                                                                                                                                                  TGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD161671             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD161685             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAGCAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGTTTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD189752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG]


>consensus_8149#0 AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTA TTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGT GGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTA TCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCC AACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAG TGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATC AACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGA TTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGA TTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATG GGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCT TCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCC TAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGT CAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATAC ATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTC TCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGC CAGTACTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)