These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8149#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 908 fasta sequence [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG] [+] EMBL CD097896 [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTTCGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGACGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCG ] [+] EMBL CD097796 [AATCTGTAGTGCCGCCCAATATTCCTGCTATCAAAGCATGAAACAAGAAGTACTTCAGTATTTGCTGTATGATGAGATGAATACGGAAGGCCAGTTATTCAGGATTAAAAAAAATGATGTGGTTCATTACGTTTTGGATGTATCTCTGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAANCGCAACATGTATGTAAGAGAATATAGCT ] [-] EMBL CD098151 [ TGATTGGTTGCAATATCCGGTTTTTTATTAATTATCCCGATTCTGGCGTTCCATTTCAGCGGTTGCAATATCGGGAGCTGCCTTTGAATAACCCAACTCTTACTGGCAAACAATCGGATTGTTTTGATAGTTTTTTCGAGTTAAAAAAAATAAGTGTCTGCGGATCTTTTCACTTTTATTTTTCAAAAGACGGATCTTCTCCTAGCCCTCCATCAACCGCAACATGTATGAAAGAAAATATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAA ] [+] EMBL CD161671 [ ATAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAACAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGATTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA ] [+] EMBL CD161685 [ TAGCTGGTTCGGGATATATTATCGTTGATCCAGATTTCACTGGTAAGCAAGTTGTCACGGAGTCCTCAGGAAATATCCGTGGAAAAAATTGGGTTTTAAGTGGCGTGGTTCTTCAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCA ] [-] EMBL CD189752 [ CAGTCTTATTTGTCTAAAAATCTTGGAATATTCCCTGAATGGGAGTCAAGACTTCATACAGTCAGGAATGGTAGTTATAATATGATTCACTTTACTCCTCTTCAAGAACTTGGGTATTCTCGTTCTGCTTATTCTCTCAAAGATCAACTCACGGTCAATCCTAGCTTTACCCCACCTGGAGCAACGAAGAAGGTAGACTGGACGGATATTGAATGCTTTGTCAAACATTTGGAAAATAATTGGGCAGTACTTAGTATGACGGACTTAGTTTTTAATCATACATCAAATGATAGCCCCTGGGTTCACGAACATCCTGAATGTGCTTACAACGTTGTTAATTCTCCTCATCTAGCTCCAGCGTATATCCTGGATCATATTGTCTGGCGTTTAACTATAGAAGCCAGTACTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||