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Schistosoma mansoni
cluster # 8160 cluster # 8160       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8160#0 length = 1239 sequences # 6  

consensusID : consensus_8160#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1239
fasta sequence
                              [GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT-AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTA-AACTATTTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA]

[+] EMBL CD083287             [GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTATNNAT ATATTGGAAATATTNnta                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD082838             [                                                                                                                                               TTGGCAGGAATTGAGAAAA TACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCANATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATNACTTAGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD139705             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATACGTTGTACGATGCGAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD076425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       nAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTTTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTAT AACTAT                                                                      ]
[-] EMBL CD076858             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCCATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTTTTTTTTTTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTTAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTTTGCATATTACAATATTTA                                                                             ]
[-] EMBL CD195760             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTAGAAGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTATAACTA TTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA]


>consensus_8160#0 GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCT GAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAAT TGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGT AGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTAC AAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTT AGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAA TACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATT TTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTA TCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAA AGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAA CATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTATAATAATATTGGAATAATT NTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCA ATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAA GAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTAT TGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTT AAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATA AAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATA CGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAA TATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTT TTTTCTGCATATTACAATATTTAAACTATTTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTAT CGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)