These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8160#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1239 fasta sequence [GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT-AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTA-AACTATTTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA] [+] EMBL CD083287 [GCCAANATTTCGGCACGAGGCGGAAATGATAGATGTCTACGTAGAGTGAATATGATATCTGAAGAGATGAGATGTATTGGTGTAACGTTTTACAAATTAAACCAACATGAATTAATTAATTGTCCCGAAAAAATGCAAAATATTTGGCAGGAATTGAGAAAATTACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTATNNAT ATATTGGAAATATTNnta ] [+] EMBL CD082838 [ TTGGCAGGAATTGAGAAAA TACCAGAGTTTCAAAGTAGACAGACGAAAATAGCAAACTGTGATAACAATGACTCAATAAGTGATTCCAGAAATTACAAGGTATATCCATTCACTACAGAAAATCAATTCGAGGATGGAAAAACTTTGCCAAATGTTAGTTCAGAAGTTCCGCAAATTGAAGAGTTAAAAAAATCTTTGGTGAAAGTAACTATTCAATACAAAATAGATTCTTCTATCTTTGACATTTTTATAGAAGAGATGAAAAATGTGAAAATTTTAAAAAATGAAACTGAAATGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATCCGTTGTACGATGCAAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTNTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCANATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATNACTTAGCATC ] [-] EMBL CD139705 [ TGATGTTTCAAGCATTATTCTGCCTTGGTAATACAACCTTATACGTTGTACGATGCGAACCGATTCGCCTTGATAAAACAAAACCATCTGATGAAGAGAAAAGCACTGATCAAAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACT ] [-] EMBL CD076425 [ nAATGACTTATTCCGCATTTACAATCATATTTCACTTCCTGATGACGAACATGTTTCAGTAAATGTTGATGTGAATCGATTATTAAACTAT AATAATATTGGAATAATTTTACAAATATTTACACGAACAGATACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCAATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTCTTTTCTCTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTAAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTAT AACTAT ] [-] EMBL CD076858 [ ACATCGAATCACTTAAGACGTGTGGCAAATATTTCAATTGGTGTGACTAAATTAACCGATAACTTAGCATCAATTCAGTGGAACGCTTTAATTAAAGAGTTAAAACAATTGAAAAGTAATAACCCATTATTTGGATCAACAAAAAAATTCACTTATTGGCATTTAATAGAATCATCCTGATTAGGGCTTTTTTTTTTCACTTTTTTTCAACTCGTTAAATCAAATATAATTGAAATGAAATAAACATTTTAACAAATGAACAGTTGACATGTTATAAAAATATATTGTGTTTATAAGTTCATAGAGAAAATGTATGAACGCATCCATGCATACATACGTACACGCATGGATATATACATACATATATACATAGAAAAGTAAATTCATATAATTGAATATACCCCGTGACTTAGATATTTGCTATTGTTTATTTGTTTGAGTAGATGAGTTAACTTTTTTTTTGCATATTACAATATTTA ] [-] EMBL CD195760 [ AGTAGAAGAGTTAACTTTTTTTCTGCATATTACAATATTTATAACTA TTGATAACGCTGTCTTACTTACATTTTTTATCGGATATACATAAAATATATTGTATACCTATTCAAAGGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||