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Schistosoma mansoni
cluster # 8161 cluster # 8161       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8161#0 length = 849 sequences # 6  
consensusID : consensus_8161#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 849
fasta sequence 
                              [GAATGAGTTAGACTTCATTTTTAA-TA-G-TATGGAATGGGAAGGAATTCATGTATTGGAGTCCTATAATCGCGCATTAGTTCAAGTTCGAGAGAGTATGGTGTCACAAGCATGGAGCCTAATCAA-TTCATCTTATGAG-TTGTCAGATAAAACTCAATTAGCTACAGGGTTACAGGTTTTCTACCATTTAAATATGTTAATGGATGTAATTCATGAACTGGTGACTAAATGGAAATCTGAGTTTGTTTCTGTACTATCCTCCTCTGTTGACATAGATTCTTTAACTCAACGAATGCGAACACGTCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACAACGTGAAACACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATATCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAATAATAAAAATTCCGAAAAATATTCTTCAATTTTGTTAATTTTTGCCTCGGCCAATTTCAAAGAAACTTTAACTCCTCAAGAAAATAACATTGATTCATCCTCTTCTATCGATAATGCAATATCTCACAACCAAATCAATGATAATCGCGCAGATATTCGTAATGCACTGATTTCANATGAAGGATTCCTTGGTTGGGCATCGGATCAACTGGCCACTANACTTTCTATTGTTTCCAATCAATCACCAGTAATTAAAGA]

[+] EMBL CD152326             [GAATGAGTTAGACTTCATTTTTAA TA G TATGGAATGGGAAGGAATTCATGTATTGGAGTCCTATAATCGCGCATTAGTTCAAGTTCGAGAGAGTATGGTGTCACAAGCATGGAGCCTAATCAA TTCATCTTATGAG TTGTCAGATAAAACTCAATTAGCTACAGGGTTACAGGTTTTCTACCATTTAAATATGTTAATGGATGTAATTCATGAACTGGTGACTAAATGGAAATCTGAGTTTGTTTCTGTACTATCCTCCTCTGTTGACATAGATTCTTTAACTCAACGAATGCGAACACGTCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD152365             [GAATGAGTTAGACTTCATTTTCAACTACGCTATGGAATGGGAAGGAATTCATGTATTGGAGTCCTATAATCGCGCATTAGTTCAAGTTCGAGAGAGTATGGTGTCACAAGCATGGAGCCTACTCAACTTCATCTTATCAGCTTGTCAGATCAAACTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD152189             [                                                                                                                                                                                                                                                   TTTGTTTCTGTACTATCCTCCTCTGTTGACATAGATTCTTTAACTCAACGAATGCGAACACGTCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACAACGTGAAACACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATATCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAATAATAAAAATTCCGAAAAATATTCTTCAATTTTGTTAATTTTTGCCTCGGCCAATTTCAAAGAAACTTTAACTCCTCAAGAAAATAAC                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD152223             [                                                                                                                                                                                                                                                                      CCTCTGGTGACATAGATTCTTTAACTCAACGAATGCGAACACGTCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACAACGTGAAACACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATATCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAATAATAAAAATTCCGAAAAATATTCTTCAATTTTGTTAATTTTTGCCTCGGCCAATTTCAAAGAAACTTTAACTCCTCAAGAAAATAAC                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD153110             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTAACTCAACGAATGCGAACACGTCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACAACGTGAAACACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATATCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAATAATAAAAATTCCGAAAAATATTCTTCAATTTTGTTAATTTTTGCCTCGGCCAATTTCAAAGAAACTTTAACTCCTCAAGAAAATAACATTGATTCATCCTCTTCTATCGATAATGCAATATCTCACAACCAAATCAATGATAATCGCGCAGATATTCGTAATGCACTGATTTCANATGAAGGATTCCTTGGTTGGGCATCGGATCAACTGGCCACTANACTTTCTATTGTTTCCAATCAATCACCAGTAATTAAAGA]
[+] EMBL CD182716             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGGGGTCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAATGGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACACCGTGAAACACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATATCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAAATATAAAAATTCCCGAAAATATTTCTCATTTTTGTTATTTTTGGCCTCGCCCAATTTCA                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_8161#0
GAATGAGTTAGACTTCATTTTTAATAGTATGGAATGGGAAGGAATTCATGTATTGGAGTC
CTATAATCGCGCATTAGTTCAAGTTCGAGAGAGTATGGTGTCACAAGCATGGAGCCTAAT
CAATTCATCTTATGAGTTGTCAGATAAAACTCAATTAGCTACAGGGTTACAGGTTTTCTA
CCATTTAAATATGTTAATGGATGTAATTCATGAACTGGTGACTAAATGGAAATCTGAGTT
TGTTTCTGTACTATCCTCCTCTGTTGACATAGATTCTTTAACTCAACGAATGCGAACACG
TCAAAAAATTCAGCAAGGAGGTTCTGGTCCAGGTAGAGCATCATTATCAGCAGTCGGTGG
TCAAGCGGCTGCTTTTCATGTTGCTATATGGACTAGTTTAGATGGAACTATTGATAAAAT
GGAACAACTTATTTCTTGTAGTCGTCTACTTGGTTTAACTCTAATGAAACAACGTGAAAC
ACATATTGATGTATGCATGACAAGTATATGTCGTTTAGACCAATATATTTCTGAATTATA
TCCTAGTCTAGCTGAGTTACTTATACACGAAATGCTTATCAACTGGCAAAATAATAAAAA
TTCCGAAAAATATTCTTCAATTTTGTTAATTTTTGCCTCGGCCAATTTCAAAGAAACTTT
AACTCCTCAAGAAAATAACATTGATTCATCCTCTTCTATCGATAATGCAATATCTCACAA
CCAAATCAATGATAATCGCGCAGATATTCGTAATGCACTGATTTCANATGAAGGATTCCT
TGGTTGGGCATCGGATCAACTGGCCACTANACTTTCTATTGTTTCCAATCAATCACCAGT
AATTAAAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)