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Schistosoma mansoni
cluster # 8196 cluster # 8196       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8196#0 length = 1167 sequences # 6  

consensusID : consensus_8196#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1167
fasta sequence
                              [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTGGNNTCTANGTTATGTCATTGTTTAATGCATAATTGTCCATGTGTATTGTTACCATCAACATACTCACATTCTCTTATTACTCTTATTAAATAATTCTTTATAGAAATTACTTTTTACAGCAGGCCAATAAATAGTGGTTGTATAAAAAAACACCCAAGGTTTCTCCAGAAAGCTCTCGTCTTTGTTTCGTTGACTGATATACCATTATGACTATCTCTGTTGTACGGTTTTTTATAGTCTGTGTTAAAACTAAATTTCCTTTCGAATAGTCATGTTTTCTTGAGATTTATCCACAAGTTGAATAAAAACAAT]

[+] EMBL AI975337             [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTTCTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI976926             [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATGTATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGGGTGTTTATTTCTATTATTGGTTTTATCTGCTCTTGGGGATGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD074675             [                                                                                                                                                                                                      GTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGATTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD082546             [                                                                                                                                                                                                                 ACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGCAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAACTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTATCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTNTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTNTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTGGNNTCTANGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI976199             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGCTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD076144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTATCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTTGGTTCTAGGTTATGTCATTGTTTAATGCATAATTGTCCATGTGTATTGTTACCATCAACATACTCACATTCTCTTATTACTCTTATTAAATAATTCTTTATAGAAATTACTTTTTACAGCAGGCCAATAAATAGTGGTTGTATAAAAAAACACCCAAGGTTTCTCCAGAAAGCTCTCGTCTTTGTTTCGTTGACTGATATACCATTATGACTATCTCTGTTGTACGGTTTTTTATAGTCTGTGTTAAAACTAAATTTCCTTTCGAATAGTCATGTTTTCTTGAGATTTATCCACAAGTTGAATAAAAACAAT]


>consensus_8196#0 AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTG GACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTC GTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAAT TAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATG TCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTT CTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGT ATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCT TCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATG AACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTA TTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGAT CAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAAT GAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTT GTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAAT GAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTT CTGATGCATGTACTGGNNTCTANGTTATGTCATTGTTTAATGCATAATTGTCCATGTGTA TTGTTACCATCAACATACTCACATTCTCTTATTACTCTTATTAAATAATTCTTTATAGAA ATTACTTTTTACAGCAGGCCAATAAATAGTGGTTGTATAAAAAAACACCCAAGGTTTCTC CAGAAAGCTCTCGTCTTTGTTTCGTTGACTGATATACCATTATGACTATCTCTGTTGTAC GGTTTTTTATAGTCTGTGTTAAAACTAAATTTCCTTTCGAATAGTCATGTTTTCTTGAGA TTTATCCACAAGTTGAATAAAAACAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)