These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8225#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 759 fasta sequence [ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTTGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC] [+] EMBL CD196452 [ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATAAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTTGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGC ] [+] EMBL CD196474 [ATTTAGATATGATGTCCGAACAAATTCAAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAACAATCGAATTAGCAGCTCCACGATTAGATAGTATGGCTAATAATCAGGTCTCATAATGTACGTCCGATAATAAGTCTGGATAAACATGGACAGTCGATAGAAAGCCAAGGGATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTA ] [+] EMBL CD196466 [ATTTAGATATAATGTCCGAACAAATTACAACTAGCTAACTACAATAAGCTGCTTATTTTAGTAGGCACAATCTGAACTCTAATTAGTGGTTAGTCACATAGCCGATTAAATGATTGGTCTCACTATAATCAATGATAAAGCGCTTGATATAGACTCATAGCCATTTCGTTTAAAGTACTTGATAAAGTATGGTTGACACTGGTATACTGAACGTTTGCAACATGAAC ] [-] EMBL CD196622 [ ATTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC] [-] EMBL CD196675 [ TTTTCTACGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC] [-] EMBL CD196543 [ CGCATTGTGTTCTGTAGACAGGTTTTTTGTTTGCAAATAAACAACACAATAGATTGGAACGTAATGTGAGGTAACTGAGTCCTGGTAATCTTAGGCTGAAGGTTACTTCTAATCGGTTTATTAATAAGTATAGTTGAGCTGTTGTCGTCGATTATAGGTTCATCAAGCTGAAGACCTGTACTCACCTCATTTAGAATCTACTTTAAGGAAAGTCTTAGGCATTTGTTTGGGTTGCACTCCCCATCGTTAGAATTAGTCGCATCGGTTGAACGTCATCGGTTTTGAACGTAATCCTAGATAGTCCGTTCTAGTTTTGCCCCGCCGGCCATAATTTATCGACAACACATAACCTAGTTTTCTTTATCATGACGCATTTGAAACCTTACTGATATCCTTCTCGATTTCAAAAATACC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||