These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8315#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1008 fasta sequence [AATATTAATTTCCATTAAAAATTACAAATACAACAAAAAAATGGTGCATATTTATGTTATATATCTGTGAATATCCAAAAAGCAACAACAAAATGTATAAAAAATAACAATATGGACATCAATGACAAACCAGTCAAAGTAATTGCACACTTCAACCTCTTTTATCACTTAAGAGTAGTATGTACAAATAATTAAAACAAATTAGAAATATCGGACATGAAGGAAAAAAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCGACGACGTCGATGTCTACTATCAACAGTACTATCATTACAAACACCAACATTGGGATCCACTTCATTAGGATATATCGTCTCATATTTTAATTCTTGATCATATTCATGTTTTACTGAGACTTCAATTGATTTATTCATTATATCTGACGGTTTACATGGTTCGAAAGAACAGGGGTGGACAATGTCACCACGTTTCCATCTACTATTCATATCTAACTTCCTTGATTTATTTGCATTTCGGCTAAACTGAAAATGTGGTTTTGTTGAATTGTTCTCTTGAGTTGAAATTTCATTTATCTCATTATTATCAGTACTAGAGATATTCCNAATAGGCCACCATGGNACATTTGCTTCTTGATTATAACCATACATTGCACGAATAGNGTCTGGGTATGACCATATAT] [+] EMBL BF936152 [AATATTAATTTCCATTAAAAATTACAAATACAACAAAAAAATGGTGCATATTTATGTTATATATCTGTGAATATCCAAAAAGCAACAACAAAATGTATAAAAAATAACAATATGGACATCAATGACAAACCAGTCAAAGTAATTGCACACTTCAACCTCTTTTATCACTTAAGAGTAGTATGTACAAATAATTAAAACAAATTAGAAATATCGGACATGAAGGAAAAAAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAG AAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGT ] [+] EMBL CD116189 [ AAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTGCAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTC ] [+] EMBL CD116204 [ AAAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAAGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTGCAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTC ] [-] EMBL CD116286 [ AAAGTGAATAGAAGAGAAACACCACACATATTTAGGTAAAACCTATACTCAGACACACATGCACACAAACGTATAAAGTTTATCGTTGGTTTGGAAGGTGAAACTAATTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCGGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCG ] [+] EMBL CD179043 [ TTGGTTGTATGAGACACCAGGAATAGATTGTTTAGTTCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAAAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGTTTTATATCACAAGTACTTATCTGTTCTCATATGTGGCAGGTAATTCAGTTCCAGCGATTGAAATTATATCTTGTCGTCGTTGTATAGTGAATTGTTTTTTAGAAGGACGAATTTTTTTAGGTTGGTTAGGTCGACGACGTCGATGTCTACTATCAACAGTACTATCATTACAAACACCAACATTGGGATCCACTTCATTAGGATATATCGTCTCATATTTTAATTCTTGATCATATTCATGTTTTACTGAGACTTCAATTGATTTATTCATTATATCTGACGGTTTACATGGTTCGAAAGAACAGGGGTGGACAATGTCACCACGTTTCCATCTACTATTCATATCTAACTTCCTTGATTTATTTGCATTTCGGCTAAACTGAAAATGTGGTTTTGTTGAATTGTTCTCTTGAGTTGAAATTTCATTTATCTCATTATTATCAGTACTAGAGATATTCCNAATAGGCCACCATGGNACATTTGCTTCTTGATTATAACCATACATTGCACGAATAGNGTCTGGGTATGACCATATAT] [+] EMBL CD067013 [ gTAGATCATTGGAAGGAATATTAAGTATAACGATTAGTTATTTAATAGAACCTTCCTTTAAAGTACAAAAATAAGAAAACTCGTATAACAAAAGAAAAAAAAAGATTTATATCACAAGTACTTATCTGACCTCATATGAGGCAGGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||