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Schistosoma mansoni
cluster # 8329 cluster # 8329       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8329#0 length = 657 sequences # 6  

consensusID : consensus_8329#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 657
fasta sequence
                              [ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATTGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]

[+] EMBL CD185524             [ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATTGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAA                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD133800             [ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAACGATTGAGCTCATTAGTCAGCAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGAGCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGATCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATT                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD185606             [ TATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATCGAGCTCATTAGTCAGTAATAATCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTTTTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGATCGTTGTTCAACTAATTGAACACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACCGCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACCCAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAATGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAGTTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTA                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD119985             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAGTTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAag]
[-] EMBL CD120207             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]
[-] EMBL CD120307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCACATGTGCCTAGACCATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGGAAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATTGGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGTTGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA]


>consensus_8329#0 ATATATGAGAGACATTATTAAGAACAGCATCTAATGATTGAGCTCATTAGTCAGTAATAA TCAAAACAGTTTTTAACACCATCCAGATTCATACCGCCAAGTATTTTTAAAACATTTCTT TTAATTTTAGTTCTATATAACAGAAGCTCATCGATTCCCGACCGTTGTTCAACTAATTGA GCACCATTCTCGTTCTGCTGATGGTTTGGTTTGTCCACTTCTTTATTCAGTACCGAAACC GCAATTTTTAAACCAACCTATGCAACAATCTTGCTATTCATCTGTCCCTCAAACATTACC CAGTTCAAGAATACCCGGTCCAAATCAATTTGAAGTCAATCCCATTGTTCACCAATCAAA TGCTGAAATATCTAACTTCCCTTTAACTCATATAAATCCCGTATCACATGTGCCTAGACC ATTTCATCCAAGTCATATAAACAATTCAGAAAGATTAAGTGCTTGTAGTGATTCTATCGG AAGTATGGAATTTGATGGATGGGAAATTGATAGGTCCGAAATTATAATGCGTCAAAAATT GGGCTGTGGTCAATATGGTGATGTATATGAAGCTGTTTGGAAACGTTTCAATTCTGTTGT TGCAGTAAAAACACTGAAACAAGATGTTAATCTGAATGTGAATGATTTTCTCAAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)