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Schistosoma mansoni
cluster # 8371 cluster # 8371       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8371#0 length = 557 sequences # 6  

consensusID : consensus_8371#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 557
fasta sequence
                              [CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT-TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT]

[+] EMBL CD090640             [CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCTCCATTATGT TTGTGTGGCNTATTGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCATTTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTACCCCATANCACANATAATACAG                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD090656             [                     ACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGTCNNGAGTGGCAGATAGGGACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGNCAGCAGNAAAGACTCTCTCCCTCTCTAGATNNCNGTCTCTCTTAACACATAACACA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD090646             [                                      AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATNGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCATCTGTNNTGACTCTCTCCCTCCCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACTTTTATTCTCTAAAACAAAATTGATTATGTTATAATAGCAGAAATTGCCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGCANGCGATTGTGATTTTAGC TTTTTTTATTATCATTATTATCCTCATCGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATTATCAATAATACAATGATTGTTNAGTTCAGATGGTGACGATGACTATGATGATGATGAATT]
[+] EMBL CD090659             [                                      AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGCGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACTGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAGCGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ]
[+] EMBL CD090665             [                                      AACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACATGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTACACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAAT ]
[-] EMBL CD090618             [                                       ACAGCGCGTATACACACCACGGTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGACTGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGT TTGTGTGGCAGATAGGTGCACATATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCCCTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAACAAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACATTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAATTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGCGACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGACGATGATGATGATGAATT]


>consensus_8371#0 CGGGAATTCTATTCCATTTCAACGAAGTTATCGTCACAAACAGCGCGTATACACACCACG GTTGCATAACCAGTATACGGTGTATATCATACAGGGAGGGGGAGTGTATGTAAGTAGGAC TGTGCTCCTCCACAAGGGGTAACAGGCAAAAGTATGTTTGTGTGGCAGATAGGTACACAT ATACACAGATTGATAAATTGTATATTTGTTAACCAATTGTCAGCTGTTTTGACTCTCTCC CTCTCTTGATTTCTTTCTCTCTTAACACATAACACAAATAATACAGATATACACGAAAAC AAAATTGATTAGGTTATAATAGTAGAAATTGTCTTTTGACATCAATTCTCACAATTTACA TTGCCGTCAACACTGTTGGTATTATTGACTAAAGTAGGCGATTGTGATTTTAGCAACGAA TTATTATCATTATTATCCTCAACGATAGGAGTAGTAGTCAAATCATTGACAATACTAAGC GACGACAAAGACTGATCATCAATAATACAATGATTGTTTAGTTCAGATGGTGATGATGAC GATGATGATGATGAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)