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Schistosoma mansoni
cluster # 8372 cluster # 8372       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8372#0 length = 1180 sequences # 6  

consensusID : consensus_8372#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1180
fasta sequence
                              [ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG-CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG]

[-] EMBL CD167191             [ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAACC CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD167164             [             CATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAANATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG AACAGCTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD167166             [                                     AAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATGCCAC GGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD200875             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGACGAACTCCAAATG AACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCCGGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI067521             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTCTGATCAACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG]
[-] EMBL CD167160             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAACCAGCGATCATTTAACTCCACTTCTA                                    ]


>consensus_8372#0 ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAAT TTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTT GTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTG TATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATAT GATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCA CTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGT GCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATGCACA GGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTG GCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAAT TGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTT GCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGT TGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAA TCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAA CAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGC AACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGG AGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGG TAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAG TGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCC CGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACT TCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)