Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8389 cluster # 8389       Sequences # 6       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8389#0 length = 1084 sequences # 4  
consensus_8389#1 length = 904 sequences # 1  
consensus_8389#2 length = 841 sequences # 1  

consensusID : consensus_8389#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1084
fasta sequence
                              [GCCATTAATTCGGCACCAGGCGGCCACTTATGATTGTGTACAACATTTCCTTAGTTCTGCTTTCGAGTTGGCTAGTATACGAATTCGCCGTTTCAGGATGGCTTACAGGATATTCTCTTGGTTGTCAAAGTGTTGATTATTCGAGAAGACCAATTGCTATGCGTATGGCCTCTACTTGCTGGTTTTTCTTCTTTTCCAAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATTTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTT-CTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTTTATTTTGTGAAATATACATCATTCATCTTATGATTTTATATACGCACACACACAAATCCATACAAATGATTATACATCCATCTACA-TGTTTTTGTTACGAA-CGTTCTGTTTTAATTGTATAGTAACATT-NTT-TTTCATGGTGAATTGATAATGG-TTATTTGATAATTTATTTTATTACATCAAATAAATTATTATAAT]

[+] EMBL CD081812             [GCCATTAATTCGGCACCAGGCGGCCACTTATGATTGTGTACAACATTTCCTTAGTTCTGCTTTCGAGTTGGCTAGTATACGAATTCGCCGTTTCAGGATGGCTTACAGGATATTCTCTTGGTTGTCAAAGTGTTGATTATTCGAGAAGACCAATTGCTATGCGTATGGCCTCTACTTGCTGGTTTTTCTTCTTTTCCAAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTTNCTTTTACCG TTTGAATGTANGATTCTATTNTGTG AATATACATCATTCATCTTATGATTTTATATACGCACACACACCAATCCATACCAATGATTATACATCCATCTACANTG TTTTGTTACGAACCGTTCTG TCTAA TGTATAGT ACATT NGT TTTCATGGNGAA TGAT ATGGNNTA TTGATAA TTA TTTATTAC TC AATAAATat       ]
[-] EMBL CD160199             [                                                                                                                              AAAGTGTTGATTATTCGAGAAGACCAATTGCTATGCGTATGGCCTCTACTTGCTGGTTTTTCTTCTTTTCCGAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTTTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATTTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTTTTCATGATTTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTT TTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTTTATTTTGTGAAATATACATCATTCATTTTATGATTTTATATACGCACACACACAAATCCATACAAATGATTATACATCCATTTACA TGTTTTTGTTACGAA CGTTTTGTTTTAATTGTATAGTAACATTGTTT TTTCATGGTGAATTGATAATGG TTATTTGATAATTTATTTTATTACATCAAATAAGTTATT     ]
[-] EMBL CD073617             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATTTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTT CTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTTTATTTTGTGAAATATACATCATTCATCTTATGATTTTATATACGCACACACACAAATCCATACAAATGATTATACATCCATCTACA TGTTTTTGTTACGAA CGTTCTGTTTTAATTGTATAGTAACATT GTTCTTTCATGGTGAATTGATAATGG TTATTTGATAATTTATTTTATTACATCAAATAAATTATTATAAT]


>consensus_8389#0 GCCATTAATTCGGCACCAGGCGGCCACTTATGATTGTGTACAACATTTCCTTAGTTCTGC TTTCGAGTTGGCTAGTATACGAATTCGCCGTTTCAGGATGGCTTACAGGATATTCTCTTG GTTGTCAAAGTGTTGATTATTCGAGAAGACCAATTGCTATGCGTATGGCCTCTACTTGCT GGTTTTTCTTCTTTTCCAAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAA AGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCAT GGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATT GTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTC AAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTG TTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCA ATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACG AAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACA AGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATTTGATAGAACTCAAC AATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCAC CAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCC GAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTTTATTTTGTGAAATA TACATCATTCATCTTATGATTTTATATACGCACACACACAAATCCATACAAATGATTATA CATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAACGTTCTGTTTTAATTGTATAGTAACATTNTTTT TCATGGTGAATTGATAATGGTTATTTGATAATTTATTTTATTACATCAAATAAATTATTA TAAT



consensusID : consensus_8389#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 904
fasta sequence
                              [CTCGCAGGCCAAAATTCGGCACGAGGGGTTTTTCTTCTTTTCCAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATATGAATCTGTTGTGTTCAACAAGTCATTTTTCATGCCTGTTTTGCCAGATAAACGAATTCCTTCTCATGATCTATTNCGAAATACCTGNATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTCTATTTTGTGAAATTACATCATTCATCTTATGATTTTATATACCCCACACCCAATCCTACAAGGATTATACCTCATTTACCTGTTTTGTTACAACAGTTTGTCTAATGGATAAAAACATTGTTTTTTTTGGGAAATGAAAAGGGTTTTGGAAATTTTTTTTTTCCTCAAAAATTTT]

[+] EMBL CD080122             [CTCGCAGGCCAAAATTCGGCACGAGGGGTTTTTCTTCTTTTCCAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATATGAATCTGTTGTGTTCAACAAGTCATTTTTCATGCCTGTTTTGCCAGATAAACGAATTCCTTCTCATGATCTATTNCGAAATACCTGNATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTCTATTTTGTGAAATTACATCATTCATCTTATGATTTTATATACCCCACACCCAATCCTACAAGGATTATACCTCATTTACCTGTTTTGTTACAACAGTTTGTCTAATGGATAAAAACATTGTTTTTTTTGGGAAATGAAAAGGGTTTTGGAAATTTTTTTTTTCCTCAAAAATTTT]


>consensus_8389#1 CTCGCAGGCCAAAATTCGGCACGAGGGGTTTTTCTTCTTTTCCAAATAATTGAATTATTT GATACCGTATTGTTTATCCTTCGAAAGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTT CATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTA GGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGT TTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGA GCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACC GATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTT ATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGA TTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTT TTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGC ATAGATATGAATCTGTTGTGTTCAACAAGTCATTTTTCATGCCTGTTTTGCCAGATAAAC GAATTCCTTCTCATGATCTATTNCGAAATACCTGNATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAAT GTAGGATTCTATTTTGTGAAATTACATCATTCATCTTATGATTTTATATACCCCACACCC AATCCTACAAGGATTATACCTCATTTACCTGTTTTGTTACAACAGTTTGTCTAATGGATA AAAACATTGTTTTTTTTGGGAAATGAAAAGGGTTTTGGAAATTTTTTTTTTCCTCAAAAA TTTT



consensusID : consensus_8389#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 841
fasta sequence
                              [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTNTGAATGTAGGATTCTATTNTGTGNAATATACATCATTCATCTTATGATTNTATATACGCACACACANCAATCCATACAAATGATTATACATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAAACGTCTGNTCTATTGTATAGAANCATTGTTCTTTCATGGNGAATTGATATGGGTATTTGATANTTATTTTATACATCAATAAATTTTATA]

[+] EMBL CD079340             [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCCGAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTNTGAATGTAGGATTCTATTNTGTGNAATATACATCATTCATCTTATGATTNTATATACGCACACACANCAATCCATACAAATGATTATACATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAAACGTCTGNTCTATTGTATAGAANCATTGTTCTTTCATGGNGAATTGATATGGGTATTTGATANTTATTTTATACATCAATAAATTTTATA]


>consensus_8389#2 GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTAT TTCATGGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTT AAATTGTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTGGCCTCAGCTGGACCTCGT TTTCAAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATC ATTGTTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTT TTCAATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTAT TACGAAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATAC GACAAGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACT CAACAATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTT TCACCAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTA TTCCGAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTNTGAATGTAGGATTCTATTNTGTGN AATATACATCATTCATCTTATGATTNTATATACGCACACACANCAATCCATACAAATGAT TATACATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAAACGTCTGNTCTATTGTATAGAANCATTGT TCTTTCATGGNGAATTGATATGGGTATTTGATANTTATTTTATACATCAATAAATTTTAT A



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8389#0      GCCATTAATTCGGCACCAGGCGGCCACTTATGATTGTGTACAACATTTCCTTAGTTCTGC 60
consensus_8389#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8389#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8389#0      TTTCGAGTTGGCTAGTATACGAATTCGCCGTTTCAGGATGGCTTACAGGATATTCTCTTG 120
consensus_8389#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8389#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8389#0      GTTGTCAAAGTGTTGATTATTCGAGAAGACCAATTGCTATGCGTATGGCCTCTACTTGCT 180
consensus_8389#2      ------------------------------------------------------------
consensus_8389#1      -----------------------------------CTCGCAGGCCAAAATTCGGCACGAG 25
                                                                                  

consensus_8389#0      GGTTTTTCTTCTTTTCCAAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAA 240
consensus_8389#2      -------------------------------------------------------GAGGC 5
consensus_8389#1      GGGTTTTTCTTCTTTTCCAAATAATTGAATTATTTGATACCGTATTGTTTATCCTTCGAA 85
                                                                               *  

consensus_8389#0      AGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCAT 300
consensus_8389#2      CAGAATTCGGCACGAGGGGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCAT 65
consensus_8389#1      AGAAATTTGAGTTAGTTAGCTTTCTTCATGTTTTTCATCATGCAATCATGCCTATTTCAT 145
                         **** *         ******************************************

consensus_8389#0      GGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATT 360
consensus_8389#2      GGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATT 125
consensus_8389#1      GGTGGTACGGTGTAAAGTATGTCCCAGGTGGTCTAGGAACTTTTCATGCATTTTTAAATT 205
                      ************************************************************

consensus_8389#0      GTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTC 420
consensus_8389#2      GTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTT-GGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTC 184
consensus_8389#1      GTATCGTTCACGCCTTTATGTATACTTACTATGGTTTGGCCTCAGCTGGACCTCGTTTTC 265
                      ************************************ ***********************

consensus_8389#0      AAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTG 480
consensus_8389#2      AAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTG 244
consensus_8389#1      AAAAGTATATATGGTGGAAAAAATACTTAACTGGAGCTCAAATAACCCAATTCATCATTG 325
                      ************************************************************

consensus_8389#0      TTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCA 540
consensus_8389#2      TTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCA 304
consensus_8389#1      TTACTTTTCACTCAACATATACATTGACTATTACCGATTGTAATTACCCAAGAGTTTTCA 385
                      ************************************************************

consensus_8389#0      ATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACG 600
consensus_8389#2      ATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACG 364
consensus_8389#1      ATTATTGGATCTTGGTATCAGCATTGGTTTTTCTTATTTTATTTTCCAAATTCTATTACG 445
                      ************************************************************

consensus_8389#0      AAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACA 660
consensus_8389#2      AAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACA 424
consensus_8389#1      AAGCCTACAAAAAACCAGTTCCTTTGGTAAACGGATTAACAGTTGATGGTAAATACGACA 505
                      ************************************************************

consensus_8389#0      AGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATTTGATAGAACTCAAC 720
consensus_8389#2      AGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAAC 484
consensus_8389#1      AGAAAACTCATTAAATTACCTTGTCAGTGTTTGTTTTTCCAACATCTGATAGAACTCAAC 565
                      ********************************************* **************

consensus_8389#0      AATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCAC 780
consensus_8389#2      AATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATAGGAATCTGTTGTTTTCAC 544
consensus_8389#1      AATTCCCTAGTGATGATGACAATCGTTATAGTTGCATAGATATGAATCTGTTGTGTTCAA 625
                      ****************************************** *********** **** 

consensus_8389#0      CAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCC 840
consensus_8389#2      CAGTTCATTTTTCATGCCTGTTTGCCAAGATAAACGAATTCCTTCTTCATGATCTATTCC 604
consensus_8389#1      CAAGTCATTTTTCATGCCTGTTTTGCCAGATAAACGAATTCCTTCT-CATGATCTATTNC 684
                      **  *******************  * ******************* *********** *

consensus_8389#0      GAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTTTATTTTGTGAAATA 900
consensus_8389#2      GAAATACCTTGTATCACCTTCTTTTACCGTTNTGAATGTAGGATTCTATTNTGTGNAATA 664
consensus_8389#1      GAAATACCT-GNATCACCTTCTTTTACCGTTTTGAATGTAGGATTCTATTTTGTGAAAT- 742
                      ********* * ******************* ************* **** **** *** 

consensus_8389#0      TACATCATTCATCTTATGATTTTATATACGCACACACACAAATCCATACAAATGATTATA 960
consensus_8389#2      TACATCATTCATCTTATGATTNTATATACGCACACACANCAATCCATACAAATGATTATA 724
consensus_8389#1      TACATCATTCATCTTATGATTTTATATAC-CCCACAC-CCAATCC-TACAAG-GATTATA 798
                      ********************* ******* * *****   ***** *****  *******

consensus_8389#0      CATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAACGTTCTGTTTTAATTGTATAGTAACATTNTT-T 1019
consensus_8389#2      CATCCATCTACATGTTTTTGTTACGAAACGTCTGNTCTA-TTGTATAGAANCATTGTTCT 783
consensus_8389#1      CCTC-ATTTACCTGTTTT-GTTAC-AACAGTTTGTCTAA--TGGATAAAAACATTGTT-T 852
                      * ** ** *** ****** ***** **   * **    *  ** ***  * **** ** *

consensus_8389#0      TTCATGGTGAATTGATAATGGTTATTTGATAATTTATTTTATTACATCAAATAAATTATT 1079
consensus_8389#2      TTCATGGNGAATTGATA-TGGGTATTTGATANTT-ATTTTAT-ACATCAA-TAAATT-TT 838
consensus_8389#1      TTTTTGGGAAATGAAAA--GGGT-TTTGGAAATT--TTTTTTTTCCTCAA--AAATTTT- 904
                      **  ***  ***  * *  ** * ****  * **  **** *  * ****  ***** * 

consensus_8389#0      ATAAT 1084
consensus_8389#2      ATA-- 841
consensus_8389#1      -----
                           




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)