Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8438 cluster # 8438       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8438#0 length = 776 sequences # 6  

consensusID : consensus_8438#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 776
fasta sequence
                              [TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT]

[-] EMBL CD160157             [TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD160175             [                                       TACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGTGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGTCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD135302             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAtt                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD159528             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATTTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCGTTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAG                                                                 ]
[+] EMBL CD159539             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAG                                                                         ]
[+] EMBL CD111389             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT]


>consensus_8438#0 TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGC TTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTC TACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGT ATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGA TATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATC AAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAA ATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTAC TGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGC ACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATA ATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTC TTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGC ATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGT CCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)