These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8472#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1215 fasta sequence [GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG-AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA] [+] EMBL AW017457 [GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTTTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTG ] [-] EMBL BG930989 [ TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAACTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCTATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT ] [-] EMBL BG931496 [ TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT ] [+] EMBL CD096402 [ GACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATT ] [+] EMBL CD189147 [ CGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGGCCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGT ] [-] EMBL CD132419 [ ccgtgtcTAGGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCGAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAG ] [+] EMBL CD134636 [ TGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||