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Schistosoma mansoni
cluster # 8472 cluster # 8472       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8472#0 length = 1215 sequences # 7  

consensusID : consensus_8472#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1215
fasta sequence
                              [GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG-AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA]

[+] EMBL AW017457             [GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTTTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BG930989             [         TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAACTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCTATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BG931496             [         TCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGCCTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGCTATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTTATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD096402             [                                                                                                                                                                                                        GACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGATGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGG AAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD189147             [                                                                                                                                                                                                                                                                CGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTGTACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCAGTTATTTAATGGCCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTCTACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGTTTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTATTCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGATCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD132419             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccgtgtcTAGGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCGAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD134636             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTGAAGACAGTGTTCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGTTTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAAATCTTTCCTGTTACTATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAACAACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCTGTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCAAATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGATTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAAGTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGTCTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATTTCTAATTCATTTAGA]


>consensus_8472#0 GGCGCTGGCTCGTCTTAACCATCATTTAAAACAAGCACAAACTGATGTCACTGTCGTAGC CTTCCTCATTTTTCCAGCTCATACGAATAGTTTTAACGTGGATTCGTTTCGTGCCCAAGC TATTGTAAAGCAACTGCGTGAAACAGTAAATTCGATCCAATGTGAAATGGGACATAGGTT ATTTGAGGTGTGTCTTCGAGGACGTATTCCTCAAGGATCTGATCTACTTACTCAGGGTGA TGTATTTCGCCTTAAACGTTGTATATATGCAACACAACGAAATAATTTGCCCCCTATTTG TACACACAATGTCGTTCAAGATAATATTGATCTAGTTCTGTGTAACTTACGCCGGTGTCA GTTATTTAATGACCGTCATGATCGTGTTAAGGTTATTTTTCATCCTGAATTCTTAAGTTC TACCAATCCACTATTACCGATGGATTATGAAGAATTTGTGCGAGGCTGTCATTTAGGTGT TTTTCCATCTTATTATGAACCATGGGGTTATACACCAGCTGAATGCACTGTAATGGGTAT TCCATCGGTAACGACAAATCTTTCTGGATTTGGCTGCTTCATAGAAGAGCATGTAGAAGA TCCCAAATCGTATGGAATATACATTGTTGATCGTCGTTTCCAAAGCTGTGAAGACAGTGT TCAACAGTTAACCAAGTATTTGGTTGAGTTCTCTCAATATTCTCGTCGTCAACGTATTGT TTTACGAAATCGTACCGAGCGATTAAGTGAACTGTTGGATTGGAAAATCTTTCCTGTTAC TATCAACGTGCCAGATTAATGGCATTAAAGAAATTCTCTCCAGAACTATTCACATCTAAC AACAATGATGATGCATTATCGACCCATAGTTTTCATATTAGTCGACCATATTCAGCACCT GTATCTCCATCACTATCTGGACAATCAACACCGTTGCGTAGTGCCGGTGCAAATAGTTCA AATCGTAGCAGTCCTACATCACATTTAGATGATGATGAAATTGATGATAACACAGAACGA TTAGAACTAGGTCTTGGTGCAATAGAAATCACTGATGCTGTACCTGGTTGAGGTACAAAA GTGAAAAAAAATATCTCATCAATATTGAACTATAAACTTAGAATGTGCCTAGTTTATTGT CTACTTTTATTTCTTCTCTTTTCATTATTTGTCATTTATTTCATTTCTTTTTTGGTCATT TCTAATTCATTTAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)