These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8480#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1360 fasta sequence [CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG-CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG] [+] EMBL CD114321 [CGCTTTCTTTCTACGTGACTGACTAATGTGTCACTGACTGCTCGCTCCGCAATCATCTTGATAACAGCGCTTTGTTGCCTAACTTCTGATGGATGTGCCGGGTCCGAATGTATCACAGTTGATGCCACTGGTCATGCATCGAATCATATACATGTTGAAGCTTATCAAGTTAGTAATCAAGCTATGGCGTTAGTGAAAGATAATATTATTGTGCCAACGTATGATGCACCTGAATTAGGTTATGTAAAAGAAACTACCAAAGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAGCCTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAA ] [+] EMBL CD080339 [ aggGAACAATTCGTTCCGGAAGTGTTTTATGCGACCAAGGATAAATATGGTAATCGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCAT ] [+] EMBL CD079174 [ CGTGTCACACGTGTCGCTCGTCCTTTACCAGTTGAGTTCCTGTTGACAAATATGCCAACAG CTTTTCCAATTGAACCATTTTATACGATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGT ] [-] EMBL CD127141 [ ATGGCTAAATTTCCTGATGATTTTCCAGTTGATTTTCAATTTCCAATTGAGAATCGTGAGTGTTTAGGTCAAATTCAAGATATACCGAGTTTTGCTCGTATACTTCATAAATTTGGAGTTGATCAAATTCATACATGTTTGACTAATTTTCATATACTTGCATGGTTAGTTAATAATGATACACTTAGTTTACAACTTTTCAACTCTGAAGGTAAATTAAATGAAGATCCATATGGGATCATTGGTTTACTAGATGCAATTGCTTTACGTTGTTCTAATCATCAATCATCTAATAATAATAATAGTTCGATAAAACAATCTGAATTAGCTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTC ] [-] EMBL CD074259 [ CTGTTAAGAAATGGGCTAAAGAATCACCAATTTGGGCTACTGTACAAGAGTTAGCTAATGCAGTTGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAGTCTGTTACTTTTGTCTNTAAAATAATAATTACTCAACGTTACCAAAAAAAG] [+] EMBL CD084357 [ cgaggGTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTTACTTTTGTCTCT TAATAATA ] [+] EMBL CD084302 [ GTTTCCGATATGCCACCTAGTCCTCCATTGCCTACTCAATCAGATTCATATCGTTCTGCGCTCAGTAGTTCTAGTGTTTCTTTAGGAGTTGGTCCAACATCAGTGCTTAAGTCAACTTGGTCATCTCAAACAACAACACCGTCGGGGACAACAGAACTACGAAATTCAGAATCTAGTCACTGGGCCTGTTCTCACTGTACTTTTCATAATAGTCCTGGTACTGATGAATGCGAAATGTGTCGCCTACCTCGACGTGGATGAAGTGTGCTGAGGTGGTAAACCGATAACAGAAAAGATCAATGAACAGTTATCTTGGTAACAATGACGCTTATTCAAGACTAATTATCTCTGCATCTACAATTTCTTTAGAGCTCGTGTATCTTTTCTTTTTACCTAAGGATGGGATAAATAAACAAGAACTTTTTCCCGTCCTCTTTTGTATGTGAATAACGTTTGTCATTTATTGTAGATTGCCCATTTTTTCATCTGAACTTTTCTTGCCCTGTACTCCTATTAATCTGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||