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Schistosoma mansoni
cluster # 8528 cluster # 8528       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8528#0 length = 1090 sequences # 7  

consensusID : consensus_8528#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1090
fasta sequence
                              [GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATTTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG--TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA-GGGGCTTTGAAACACAACA-TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT]

[+] EMBL CD199310             [GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATATTGAATGAATTTTCCTTTTTCCCCGTCGCCACTGTTATAATTGTATTTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD114860             [                                                                                                                                                               TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG  TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD114861             [                                                                                                                                                               TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG  TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTNTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD114939             [                                                                                                                                                               TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG  TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATANGGGGCTTTGAAACACAACATTTTTTGGTCACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD115079             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAAGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA                                                                    ]
[-] EMBL CD115011             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGGGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA                                                                    ]
[-] EMBL AI975974             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgccatGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATGGCAGAAAAAAAAGCTGGAATAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT]


>consensus_8528#0 GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTT AAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTG CTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATTTTGAATGAATTTTCCTTTTT CCTCGTCGCCACTGTTATAATTGTGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGC TTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGA ATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGT TCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGG GCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGC TTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATAGGGGCTTTGAAACACAACATTTTTGGTCACT TTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCG TGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGAC AAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTC TACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAA GGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTC GTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATT AAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAG TAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTT AAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAA TAAATTGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)