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Schistosoma mansoni
cluster # 8529 cluster # 8529       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8529#0 length = 1136 sequences # 7  

consensusID : consensus_8529#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1136
fasta sequence
                              [TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA]

[-] EMBL CD168727             [TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD131242             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCATGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACC AAAACACGAAACAATGGATTC AATCATTCGTCCAAAGTT                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD130482             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtgACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTAGTCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD130450             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD129504             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCCTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA]
[+] EMBL CD156165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTGATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATA                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD156386             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGATAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATGTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTAGTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAA                                                                                                                                           ]


>consensus_8529#0 TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTG ATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGC GGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCT AATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCC TACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATC CGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGAT GGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACT AAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAAT TTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTG ACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTT ATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGT GCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTT TTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCA TTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCA GCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCA TTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCT ATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAA ACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTT TTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)