These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8529#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1136 fasta sequence [TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA] [-] EMBL CD168727 [TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATA ] [+] EMBL CD131242 [ CATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCATGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACC AAAACACGAAACAATGGATTC AATCATTCGTCCAAAGTT ] [+] EMBL CD130482 [ tgtgACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTAGTCAC ] [+] EMBL CD130450 [ CTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTAT ] [-] EMBL CD129504 [ TACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCCTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA] [+] EMBL CD156165 [ TTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTGATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATA ] [-] EMBL CD156386 [ TGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGATAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATGTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTAGTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||