These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8535#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1065 fasta sequence [TGGGTTTCAGATATCCTAGATTGCAGTGTTTTCAGCTTATAGGATATAAACAACATCCTTAGCTAAGTGTTCACAATACACTAGTTGACGATGTATGATTCTCGCCACATTTCTATTCCATTAAAGTGATTACTTTTTAAATTTGATCTACATCATAGCCACAACTAATTCGAGTGTGGTATTTCAGCCTTCGCAACTAC-TGTG-TA-CAAATGAAACTTTACTGAATTACTTGATATACGTTATGAACACAGAAGTGGGTAGATTAAATGCGTACAAAGAAAAAACTAAAGTTGACGGTGAAGAGCTAGTACTCAATGTCTTTCCAAAACGTGTATTTGAAATGGAAGACATATTAGCGTCGGACATGTTTTTTCTAGAGGGGAAGTATGTCCATTCTGATGTGAATGTACCTTATCCTGTTAATCCACATAATTCGTTACATTCTGGTGGTGATATGGATTCTGATTTATCCAATGCTGCAGATAAGCTGACCAATGATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTTCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGTTCGTTTATGGGTTCAATTTAATATACCACGAATTGAAGATGGAAATAATTTCGGTGTAGGAATTCAAGAAGAGATTTTAGGTGAAGCATCGGGTATCGAGAGGGATGCATGTACTTTCTTGGATCAAGTCACAAGATATTATGCCTCAAGAGGAAAATTAGTGGGTAAAGTGGCAAAATATCCACATATTGAAGACTATCGTGAATGTATCCGTGATATGGATGAGAAA-CAAGCAATAACAATGCGTTATATTATTATGGAAAT-CCGTAATCACTATGCTACCTTACATGATAT-AATAATAAAAAATTTGGATCGTATAAAAATG-CCTCGTTCCAATAATGCAATCAATATGTACTAATTGATAAAACCCAGA-TTTAGTTCTGTGTTTGCTCATATTATGAAATTTTGATTGTATGTAAATACATACGT] [+] EMBL CD078919 [TGGGTTTCAGATATCCTAGATTGCAGTGTTTTCAGCTTATAGGATATAAACAACATCCTTAGCTAAGTGTTCACAATACACTAGTTGACGATGTATGATTCTCGCCACATTTCTATTCCATTAAAGTGATTACTTTTTAAATTTGATCTACATCATAGCCACAACTAATTCGAGTGTGGTATTTCAGCCTTCGCAACTACATGTG TATCAAACGAAACTTTACTGAATTACTTGATATACGTTATGAACACAGAAGTGGGTAGATTAAATGCGTACAAAGAAAAAACTAAAGTTGACGGTGAAGAGCTAGTACTCAATGTCTTTCCAAAACGTGTATTTGAAATGGAAGACATATTAGCGTCGGACATGTTTTTTCTAGAGGGGAAGTATGTCCATTCTGATGTGAATGTACCTTATCCTGTTAATCCACATAATTCGTTACATTCTGGTGGTGATATGGATTCTGATTTATCCAATGCTGCAGATAAGCTGACCAATGATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTTCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCANAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTT ] [+] EMBL CD079917 [ CAAGCAC TGTGCTA CACGTGAAACTTTACTGAATTACTTGATATACGTTATGAACACAGAAGTGGGTAGATTAAATGCGTACAAAGAAAAAACTAAAGTTGACGGTGAAGAGCTAGTACTCAATGTCTTTCCAAAACGTGTATTTGAAATGGAAGACATATTAGCGTCGGACATGTTTTTTCTAGAGGGGAAGTATGTCCATTCTGATGTGAATGTACCTTATCCTGTTAATCCACATAATTCGTTACATTCTGGTGGTGATATGGATTCTGATTTATCCAATGCTGCAGATAAGCTGACCAATGATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTTCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGTTCGTTTATGGGTTCAATTTAATATACCACGAATTGAAGATGGAAATAATTTCGGTGTAGGAATTCAAGAAGAGATTTTAGGTGAAGCATCGGGTATCGAGAGGGATGCATGTACTTTCTTGGATCAAGTCACAAGATATTATGCCTCAAGAGGAAAATTAGTGGGTAAAGTGGCAAAATATCCACATATTGAAGACTATCGTGAATGTATCCGTGATATGGATGAGAAANNCAGC ATANNCATGCGTTATATTATTATGGAAATNCCGT ATCACTATGCTACCTTACATGATATNNAT ATAAAAAATTGGNATCGTAT AAAATGCCCTCGTCCCCAT ATGC ATC ATATGTACTATTTGAT AACCC GATTTTAG TCTG GGTTGCTCATA TATGAAATTTTGA TG ATG AANTACAT ] [+] EMBL CD140310 [ ATGAAACTTTACTGAATTACTTGATATACGTTATGAACACAGAAGTGGGTAGATTAAATGCGTACAAAGAAAAAACTAAAGTTGACGGTGAAGAGCTAGTACTCAATGTCTTTCCAAAACGTGTATTTGAAATGGAAGACATATTAGCGTCGGACATGTTTTTTCTAGAGGGGAAGTATGTCCATTCTGATGTGAATGTACCTTATCCTGTCAATCCACATAATTCGTTACATTCTGGTGGTGATATGGATTCTGATTTATCCAATGCTGCAGATAAGCTGACCAATGATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTCCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGT ] [-] EMBL CD074114 [ GGATTCTGATTTATCCAATGCTGCAGATAAGCTGACCAATGATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTTCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGTTCGTTTATGGGTTCAATTTAATATACCACGAATTGAAGATGGAAATAATTTCGGTGTAGGAATTCAAGAAGAGATTTTAGGTGAAGCATCGGGTATCGAGAGGGATGCATGTACTTTCTTGGATCAAGTCACAAGATATTATGCCTCAAGAGGAAAATTAGTGGGTAAAGTGGCAAAATATCCACATATTGAAGACTATCGTGAATGTATCCGTGATATGGATGAGAAA CAAGCAATAACAATGCGTTATATTATTATGGAAAT CCGTAATCACTATGCTACCTTACATGATAT AATAATAAAAAATTTGGATCGTATAAAAATG CCTCGTTCCAATAATGCAATCAATATGTACTAATTGATAAAACCCAGA TTTAGTTCTGTGTTTGCTCATATTATGAAATTTTGATTGTATGTAAATACATACGT] [-] EMBL CD073376 [ ATAAACAACAGTTTCCTAGTAAAGGTTCTTTTGTCTACGCCTTACCAAATGGTTCTGTGTCATACAATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGTTCGTTTATGGGTTCAATTTAATATACCACGAATTGAAGATGGAAATAATTTCGGTGTAGGAATTCAAGAAGAGATTTTAGGTGAAGCATCGGGTATCGAGAGGGATGCATGTACTTTCTTGGATCAAGTCACAAGATATTATGCCTCAAGAGGAAAATTAGTGGGTAAAGTGGCAAAATATCCACATATTGAAGACTATCGTGAATGTATCCGTGATATGGATGAGAAA CAAGCAATAACAATGCGTTATATTATTATGGAAAT CCGTAATCACTATGCTCCCTTACATGATAT AATAATAAAAAATTTGGATCGTATAAAAATG CCTCGTTCCAATAATGCAATCAATATGTACTAATTGATAAAACCCAGA TTTAGTTCTGTGTTTGCTCATATTATGAAATTTTGATTGTATGTAAATACATACGT] [-] EMBL CD075252 [ ATAAACATATCAAAGCTATGATAGAGAAAACTAAACCGTGTTTAACTCAACTTATGATCGAAGCTCAACTTGTTCGTTTATGGGTTCAATTTAATATACCCCGAATTGAAGATGGAAATAATTTCGGTGTAGGAATTCAAGAAGAGATTTTAGGTGAAGCATCGGGTATCGAGAGGGATGCATGTACTTTCTTGGATCAAGTCACAAGATATTATGCCTCAAGAGGAAAATTAGTGGGTAAAGTGGCAAAATATCCACATATTGAAGACTATCGTGAATGTATCCGTGATATGGATGAGAAA CAAGCAATAACAATGCGTTATATTATTATGGAAAT CCGTAATCACTATGCTCCCTTACATGATAT AATAATAAAAAATTTGGATCGTATAAAAATG CCTCGTTCCAATAATGCAATCAATATGTACTAATTGATAAAACCCAGA TTTAGTTCTGTGTTTGCTCATATTATGAAATTTTGATTGTATGTAAATACATACGT] consensusID : consensus_8535#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||