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Schistosoma mansoni
cluster # 8553 cluster # 8553       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8553#0 length = 1066 sequences # 7  

consensusID : consensus_8553#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1066
fasta sequence
                              [CCATATTCGGCACGAGGATTTTTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT-A-ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAG-AAATAGCGATTCATAGA-TTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTAC-TTTTTACTCTTTTT-ACAAGGCAAATCTGTGAATATG-TGTTG-TAATGATG-TTTATTTTGATAGTT---AAATTC-TACTAAC]

[+] EMBL CD081629             [CCATATTCGGCACGAGGATTTTTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT A ACATACAGTTCATTACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTG AAACTATATCTTTGCAAG AAATAGCGATTCATAGA TTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTAC TTTTTACTCTTTTT ACCAGGCCAATCTGNGATAATG TGNTG TAATGATG TTTATTCTGATAGTT   AAATTC TACT   ]
[+] EMBL CD080168             [                     TTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTTAGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTACTAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGTAATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACCAAATATCANAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD140967             [                                                                                                                                                                                                                             GAATCGTCCAAACT GTTTTATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCTGTTAGTCCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTCGAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTAAATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTT ANACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTANACTATATCTT                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AW018284             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATCCTAAGAATGACTAATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGAT AAAACATTTCGGGAACAAATTTTC AAGGTATGATGCATGCTTTCAAAGGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD075452             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTTAA ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAGAAAATAGCGATTCATAGATTTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTACTTTTTTACTCTTTTTAACAAGGCAAATCTGTGAATATGTTGTTGTTAATGATGTTTTATTTTGATAGTTTTAAAATTCATACTAAC]
[-] EMBL CD073427             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACTGTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTTCTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGAGAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGAAAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGTTTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAATTTAA ACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAAACTATATCTTTGCAAGAAAATAGCGATTCATAGATTTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTTTTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTACTTTTTTACTCTTTTTAACAAGGCAAATCTGTGAATATGTTGTTGTTAATGATGTTTTATTTTGATAGTTTTAAAATTCATACTAAC]


>consensus_8553#0 CCATATTCGGCACGAGGATTTTTTTACTGTGCCTATCGCTCGATATTTGGATGGGGCGTT AGTGTTGACACAAGTTCCCGCACTTTTGTTTAGCAAAATAACTAGTTACTTTGTGCCTAC TAGTTTCTAAGAATTGTTTTCAACCTCTTTTTGAATATCATCAGTTTAAATTCGTATCGT AATTCATTCAGTTCTCTTCACAAACTTTCCATTTCTCAAATGAATCGTCCAAACTGGTTT TATACACTATATTTAACTGTTATTCAATTTATCATCTATGGAGTTTGTGAAGAGTTATCT GTTAGTCCTATCGCTCAAGCACTACGTGTTCATGAATCTGGAATTTTTGAATGTTCTTTC GAAAACTCATCCTATAATTCGGATTTAAGGTGGATATTGTTTGACGGGACAGTTCTATTA AATGGTAACACATCAGAAGATGGTCGATTTATTAATGAAGATGGTATCCTAAGAATGACT AATCTTACTATACCTGATTCTGGTGAATATAACTGTGAAAATCTTGAAATCAATACCACT GTTACTGCTCATCTTAAAGTGTATATTATGCCATCTTATTTGTTGGAAGGATCCATTGTT CTTGCTATCAATGGTATTCTCTTCATTCTATTCATTTATTCAATGATAAAAACATATCGA GAACAAAATATCAAAGATAGTATGCATGCTTTCTAATGGTTTATTATTTACTTGATGGGA AAGATTTCTCTCTCTGATCCTGTTTTTTACATCATCAACTTCAGTTCCTTATCCATTAGT TTTCTTTTGCGTGAATTCACTGAATAATATGATTACATGTGTTATACTATGCTTTATAAT TTAACATACAGTTCAATACACTCACTTGTGTTTGGTATTCATCTCTTAGATATGTTGTAA ACTATATCTTTGCAAGAAATAGCGATTCATAGATTTTTTGCAGTTATGAAACTCATTGTT TTGTTTTCTGCATTCTGAGATCACCTTACTTTTTACTCTTTTTACAAGGCAAATCTGTGA ATATGTGTTGTAATGATGTTTATTTTGATAGTTAAATTCTACTAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)