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Schistosoma mansoni
cluster # 8558 cluster # 8558       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8558#0 length = 1219 sequences # 7  

consensusID : consensus_8558#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1219
fasta sequence
                              [NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG]

[+] EMBL CD073967             [NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAAAAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD075577             [                                         ACACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD074234             [                                         ACACTAATTATGTGTTAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD080314             [                                          CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD081864             [                                          CACTAATTATGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTTTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI067849             [                                                   TGTGTGAATGCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTACAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAACATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTATGTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAGATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGGTAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAGAATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD079709             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTNTGTNTGGATTATATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACACACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCACCTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTGAACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAAACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTGTGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATGAAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGATCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAGATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGTTTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCAATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGCCCTCGTGCCGAATTTTTGG]


>consensus_8558#0 NCGCGGNACATTGTTTTTTTTATCTTTTTTTTACATAAATTACACTAATTATGTGTGAAT GCAATAGAAATTATGTACATGGCAAAAATAAAAAATAATTCATATTAGTAGTGTGTTGTA CAATTACAGTTACGAGCACTACTACTGCTACTACTACCATTGATACTAACCACAACAAAA CATTCTGATGGAAAAGTGCACACAAACAAAAAATTACAATTATATAATATACATATGTAT GTACGTTAAACAAAAAGATAAAAACCCGTGTACAACAATATTCATCTACACCTGCCACAG ATCTGGAACGAAAAAACAAGGAATATGAGAAATGCAAACAGCCAAGATATATGGAATAGG TAAGTATAGATATATATAAAAGACATACACATATATACTAATACAACAGGAAAATATAAG AATGAAATACATCGATGTACTACAACATACATGTATGTATATCGATGATGAGAAGGAAAA AAAATAGTCACTTCATTGGAATCAAAGGGATTAAGTCTTCTGTTTTTTTTGTTTGGATTA TATAAAAAATTAAGCTGAAAAATAGTCTAGGGTAATCGCTTTCTATTTGTGATACAACAC ACACACACACACACGAGATTTTTTTAATGAACGAGGGGGGGGCGGAAGGGAATTGTTCAC CTTTTGTTATTGTAACCCAAACATGGTATTCAATTTCAACACATACATACATGCTAACTG AACTCTATCTAATTAGATGAACTGCATTATTCTACCACAGTTCATCTTTTTTTTTAAAAA ACCTCATGTTTACTGAAATGTTTTTCTTGTAAAAATAAATTTGTTTGTTTCATAAGTGTG TGTGTGTATGTGCAATGAATGATTAATTCAATGAAGGCTATCTTTATCTTCCTACTAATG AAGTCCCTTTAAAAAAAAAGAAAAACTCGATGGGATAACGAGAATGATGAAAAAATAAGA TCAAAAATTTTTGTCAAAAAAGATAGTAGAGTTTAGGGATGAGAAAAATAGCAACAATAG ATCTCCCTATTCCTTCTTACATAGTAATACAAACGAGGTTGATAGGGGTAGAGTGTGTGT TTGGGGGGGGGGTAAGGACTAAAAGCATGTCAAAATAAAAAATAGAGCATCGTATGTGCA ATCAATCATACACTAGAACAGTCTACCACAATGCAATAGGGTATTAAAAAATAATTTCGC CCTCGTGCCGAATTTTTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)