These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8569#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 754 fasta sequence [CAGAGATTTACTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT----TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT-GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC-CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCCAAATTGAATGAATGCCTAGTGCCTGGTTCAAAAACTGCGAATTCATGACTATATGATACACCCGGTACAACCCCAGCACCACCGACCAGAAGC] [+] EMBL CD073462 [CAGAGATTTAATTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAAAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAAATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGC ] [+] EMBL CD077295 [CAGAGATTAACTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTNTAAGTAAAGCTGTTTCAATTNTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTG ] [+] EMBL CD076976 [CAAAGATTTCCTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAATCGCTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTACTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTANATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTACACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTCTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCG ] [+] EMBL CD075385 [ ATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAA ] [+] EMBL CD178772 [ GAATTTAGAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCCGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCC ] [-] EMBL AA566209 [ AATACTAGTCATAAGTT AAATTAGATTC AAC TATGACTACTATAC AAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTTGGAACTGAGTTGTAGATGAAGAACACACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAAT ] [+] EMBL CD131149 [ TGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCCAAATTGAATGAATGCCTAGTGCCTGGTTCAAAAACTGCGAATTCATGACTATATGATACACCCGGTACAACCCCAGCACCACCGACCAGAAGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||