Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 859 cluster # 859       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_859#0 length = 796 sequences # 2  

consensusID : consensus_859#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 796
fasta sequence
                              [CTACCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGAATTTCTCTGGATTTTGGAGTGTGGATACTATACGAATAGGCTCGTTGGTGATTCGGAATCAAGCGTTCGCAGAAATGAGGAATATATTTAATCTCGATTACTACAATTGTAAATATGATGGAATAATTGGCATGTCGAGTAGGAGGATATCAGAATATGGAAACATTCCGATGTTCCCGAATATACTGGCAAACGGTGTGAATATGGATCCAATATTTTCATTTTATTTAAATCGGAAAAGTGGCTCAGCAATCGGTGGTGAATTAGTACTTGGCGGTTTCAATCCACAATATTTCAAGGGTGATTTTGAATATATACCTACTGTTCACAATTATATGTGGGTGATTCAAATGTTAAGTTTACTAACGTCAATGGGAATCGAAAGGACAGAGATCGACAATTTACTTAGTTACTGACTTTACGTCTGTTACCCTTCGTGAGTCATAGACCGCCGATCAGAATTCTTCAACCAACTATTTCTTGAGCTCTGCTTTCCAGTTGTTTCCAAGTGTTATCTATTCTTTTGATGTCTGCATCCAGTTCCCTTTGCGATGTATTCCTTCGTCTACCTCTNTTCCTTAAGTATTCAGAATTGCANATTCAGGTTNTCGTCATGATGTAGTTTGATAATTTCCGCAATACATGTCCCACTCACTACAAGTGTCCTTTTGCAATTCCCACTTCAATTAAAAGCTTATTTTAAATAAATCAATAACAATCTACCCAATGCTCAATTTGTTCAAAATTATCAAATAAAAACTTGGTAAT]

[+] EMBL CD082885             [CTACCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGAATTTCTCTGGATTTTGGAGTGTGGATACTATACGAATAGGCTCGTTGGTGATTCGGAATCAAGCGTTCGCAGAAATGAGGAATATATTTAATCTCGATTACTACAATTGTAAATATGATGGAATAATTGGCATGTCGAGTAGGAGGATATCAGAATATGGAAACATTCCGATGTTCCCGAATATACTGGCAAACGGTGTGAATATGGATCCAATATTTTCATTTTATTTAAATCGGAAAAGTGGCTCAGCAATCGGTGGTGAATTAGTACTTGGCGGTTTCAATCCACAATATTTCAAGGGTGATTTTGAATATATACCTACTGTTCACAATTATATGTGGGTGATTCAAATGTTAAGTTTACTAACGTCAATGGGAATCGAAAGGACAGAGATCGACAATTTACTTAGTTACTGACTTTACGTCTGTTACCCTTCGTGAGTCATAGACCGCCGATCAGAATTCTTCAACCAACTATTTCTTGAGCTCTGCTTTCCAGTTGTTTCCAAGTGTTATCTATTCTTTTGATGTCTGCATCCAGTTCCCTTTGCGATGTATTCCTTCGTCTACCTCTNTTCCTTAAGTATTCAGAATTGCANATTCAGGTTNTCGT                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD076469             [                                                                                                                                                              CATGTCGAGTAGGAGGATATCAGAATATGGAAACATTCCGATGTTCCCGAATATACTGGCAAACGGTGTGAATATGGATCCAATATTTTCATTTTATTTAAATCGGAAAAGTGGCTCAGCAATCGGTGGTGAATTAGTACTTGGCGGTTTCAATCCACAATATTTCAAGGGTGATTTTGAATATATACCTACTGTTCACAATTATATGTGGGTGATTCAAATGTTAAGTTTACTAACGTCAATGGGAATCGAAAGGACAGAGATCGACAATTTACTTAGTTACTGACTTTACGTCTGTTACCCTTCGTGAGTCATAGACCGCCGATCAGAATTCTTCAACCAACTATTTCTTGAGCTCTGCTTTCCAGTTGTTTCCAAGTGTTATCTATTCTTTTGATGTCTGCATCCAGTTCCCTTTGCGATGTATTCCTTCGTCTACCTCTTTTCCTTAAGTATTCAGAATTGCAAATTCAGGTTTTCGTCATGATGTAGTTTGATAATTTCCGCAATACATGTCCCACTCACTACAAGTGTCCTTTTGCAATTCCCACTTCAATTAAAAGCTTATTTTAAATAAATCAATAACAATCTACCCAATGCTCAATTTGTTCAAAATTATCAAATAAAAACTTGGTAAT]


>consensus_859#0 CTACCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGAATTTCTCTGGATTTTGGAGTGTGGATACTATA CGAATAGGCTCGTTGGTGATTCGGAATCAAGCGTTCGCAGAAATGAGGAATATATTTAAT CTCGATTACTACAATTGTAAATATGATGGAATAATTGGCATGTCGAGTAGGAGGATATCA GAATATGGAAACATTCCGATGTTCCCGAATATACTGGCAAACGGTGTGAATATGGATCCA ATATTTTCATTTTATTTAAATCGGAAAAGTGGCTCAGCAATCGGTGGTGAATTAGTACTT GGCGGTTTCAATCCACAATATTTCAAGGGTGATTTTGAATATATACCTACTGTTCACAAT TATATGTGGGTGATTCAAATGTTAAGTTTACTAACGTCAATGGGAATCGAAAGGACAGAG ATCGACAATTTACTTAGTTACTGACTTTACGTCTGTTACCCTTCGTGAGTCATAGACCGC CGATCAGAATTCTTCAACCAACTATTTCTTGAGCTCTGCTTTCCAGTTGTTTCCAAGTGT TATCTATTCTTTTGATGTCTGCATCCAGTTCCCTTTGCGATGTATTCCTTCGTCTACCTC TNTTCCTTAAGTATTCAGAATTGCANATTCAGGTTNTCGTCATGATGTAGTTTGATAATT TCCGCAATACATGTCCCACTCACTACAAGTGTCCTTTTGCAATTCCCACTTCAATTAAAA GCTTATTTTAAATAAATCAATAACAATCTACCCAATGCTCAATTTGTTCAAAATTATCAA ATAAAAACTTGGTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)