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Schistosoma mansoni
cluster # 860 cluster # 860       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_860#0 length = 518 sequences # 2  

consensusID : consensus_860#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 518
fasta sequence
                              [GATGCGCACTTCTGAGGAGTCCCATAATAGGACGAAACAGCCGTCCAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGATCTAGCTTCAATTGAATCATGATTTCAATTAGCGTTTTAAATCCAACCCGTACCAAAAAAAACCAGGCGTTTCTTGCAATTAAGCTTACACACCACGTCATTATTTATTATGTTTGGTTGCACAAAAGATAAATTTATCAACTTTCCAACATTTTCAGAACTAAATACAGAGATTGATTACTTGGCTTTAGGTAAAATACAGGCTATCTGACAATGGGTTTTGACTTGCTTGCGAAAATTTCAGTCTCTATTTGAAATTTGATGTGATCAGTACAATGTAGTTGAATTTATTAATAAAAAATCTGTTGTTCTAAATGTACATTTTTACTCAATTTAAACTCTTAAAATCATTTAGCAATTTAACAATCAAACGACTTTGATAGGTGATTTTGTATGTTGTCACTTAAATCACTAAAACTCAATAATCTCCACGACCTTATACTGATA]

[+] EMBL CD198168             [GATGCGCACTTCTGAGGAGTCCCATAATAGGACGAAACAGCCGTCCAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGATCTAGCTTCAATTGAATCATGATTTCAATTAGCGTTTTAAATCCAACCCGTACCAAAAAAAACCAGGCGTTTCTTGCAATTAAGCTTACACACCACGTCATTATTTATTATGTTTGGTTGCACAAAAGATAAATTTATCAACTTTCCAACATTTTCAGAACTAAATACAGAGATTGATTACTTGGCTTTAGGTAAAATACAGGCTATCTGACAATGGGTTTTGACTTGCTTGCGAAAATTTCAGTCTCTATTTGAAATTTGATGTGATCAGTACAATGTAGTTGAATTTATTAATAAAAAATCTGTTGTTCTAAATGTACATTTTTACTCAATTTAAACTCTTAAAATCATTTAGCAATTTAACAATCAAACGACTTTGATAGGTGATTTTGTATGTTGTCACTTAAATCACTAAAACTCAATAATCTCCACGACCTTATACTGATA]
[+] EMBL CD198056             [GATGCGCACTTCTGAGGAGTCCCATAATAGGACGAAACAGCCGTCCAGTGCTTCCAGGTTTTCCATGGTGATCTAGCTTCAATTGAATCATGATTTCAATTAGCGTTTTAAATCCAACCCGTACCAAAAAAAACCAGGCGTTTCTTGCAATTAAGCTTACACACCACGTCATTATTTATTATGTTTGGTTGCACAAAAGATAAATTTATCAACTTTCCAACATTTTCAGAACTAAATACAGAGATTGATTACTTGGCTTTAGGTAAAATACAGGCTATCTGACAATGGGTTTTGACTTGCTTGCGAAAATTTCAGTCTCTATTTGAAATTTGATGTGATCAGTACAATGTAGTTGAATTTATTAATAAAAAATCTGTTGTTCTAAATGTACATTTTTCCTCAATTTAAACTCTTAAAATCATTTAGCAATTTAACAATCAAACGACTTTGATAGGTGATTTTGTATGTTGTCACTTAAATCACTAAAACTCAATAATCTCCACGACCTTATACTGA  ]


>consensus_860#0 GATGCGCACTTCTGAGGAGTCCCATAATAGGACGAAACAGCCGTCCAGTGCTTCCAGGTT TTCCATGGTGATCTAGCTTCAATTGAATCATGATTTCAATTAGCGTTTTAAATCCAACCC GTACCAAAAAAAACCAGGCGTTTCTTGCAATTAAGCTTACACACCACGTCATTATTTATT ATGTTTGGTTGCACAAAAGATAAATTTATCAACTTTCCAACATTTTCAGAACTAAATACA GAGATTGATTACTTGGCTTTAGGTAAAATACAGGCTATCTGACAATGGGTTTTGACTTGC TTGCGAAAATTTCAGTCTCTATTTGAAATTTGATGTGATCAGTACAATGTAGTTGAATTT ATTAATAAAAAATCTGTTGTTCTAAATGTACATTTTTACTCAATTTAAACTCTTAAAATC ATTTAGCAATTTAACAATCAAACGACTTTGATAGGTGATTTTGTATGTTGTCACTTAAAT CACTAAAACTCAATAATCTCCACGACCTTATACTGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)