These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8609#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 965 fasta sequence [GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD131985 [GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGC ] [+] EMBL CD166264 [ TTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTA ] [+] EMBL CD194670 [ GCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTCTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTATACTACTTGTGTCCATCCTTAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCCTTGGGTCT ] [+] EMBL CD201118 [ TTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCTGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCATTTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTAGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTA ] [+] EMBL CD129919 [ AGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGC ] [-] EMBL AI394967 [ cTAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGACCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD093819 [ TTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGCTTATGTGGTGATGATCTAACGATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||