Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8609 cluster # 8609       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8609#0 length = 965 sequences # 7  

consensusID : consensus_8609#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 965
fasta sequence
                              [GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD131985             [GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTTTCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD166264             [                                                                                     TTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAGCAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD194670             [                                                                                                                            GCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAGAGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTAGGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTCTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTATACTACTTGTGTCCATCCTTAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCCTTGGGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD201118             [                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCTGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCATTTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTAGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD129919             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTCGTTCAATGCGTCGTGAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCTAAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTTGGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCCTCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACTTACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCATGGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGATCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGC                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AI394967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cTAAAAAATTGTTCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGACCCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGATTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATATTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD093819             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATATATATGTAATTGCTTATGTGGTGATGATCTAACGATT                                                                                         ]


>consensus_8609#0 GGGTATTTCGATTTGCTACCTTACTCAGCAATGTTTAGAAATCAATATGACCACGATGTT TCCATATGGAGTCCACAAGGACGAATTCATCAAATCGAATATGCTATGGAAGCTGTAAAG CAGGGCTCAGCAGCAGTCGCCTTGAAGAATCATGACTACGCCATAATTGTTGCCTTAAAG AGAGCACCATCCGAGCTCTCTTCCTACCAAGAAAAGATCATTCAAATAGATGATCATGTA GGGGTGGCAATTTCGGGTTTAACTGCTGATGGCCGGCTTCTTAGTCGTTCAATGCGTCGT GAGTGTGCGGATAGCAGATGGGCATATGATGAGCCACTCCCAATTTCACGTCTGCTTTCT AAAATAGCTCTCAAGATGCAAGTTCCTACTCAGAGATACGGTCGACGACCTTTCGGAGTT GGTATGCTAGTTACTGGTTGTGATGCCTTGGGACCACATGTTTACTACTTGTGTCCATCC TCAAACGCATACGATTGCAAATGCATAGCCATTGGTTCTCGCTCTCAGTCAGCTCGTACT TACTTGGAACGACATTTAAATGAATTTAAAGGTTCATCTTTGGACGATTTAATTTGTCAT GGATTGAAAGCTTTAAACAGCACGTTGCCAAATGAAGTCAGTTTGAACATAAAAAATTGT TCACTTGCTATAGTTGGAAAAGACATGAAATTCACAATATTTGAAGATGATGATATTGAT CCATATTTGAAGTTATTCGAAGCTACTCAAGTGGATGCACCAGCTGCAGCTATCCCCGAT TCTGGTCCTACTCCTATGGAACAGGATCAGTCTGCGTTGTAGCCGGTTATCTATCTATAT ATATGTAATTGTTTATGTGGTGATGATCTAACGATTATTCTGAGTCCTAACTTGTTTATA TTTTCGATTTGTAACGACAAGTTAATAAAGCTGAGTTATGAAATTCAAAAAAAAAAAAAA AAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)