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Schistosoma mansoni
cluster # 8623 cluster # 8623       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8623#0 length = 1280 sequences # 7  

consensusID : consensus_8623#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1280
fasta sequence
                              [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT-ATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT]

[+] EMBL CD170629             [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD170577             [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACGAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCACAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATCGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCAAAAACCATTNTCTCTAAATGAACTTCAAAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTCGTCGNTCTAGCCAACTTGCACCACAACAATCT AATTANGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD170656             [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGAGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGTTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGTTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGCCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAACTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTCTGCATCTGTGCATATTATCTCATCGGAACATTGCGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD161721             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT ATCGA                                                                                                         ]
[+] EMBL CD181793             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCANATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATTAAGAAGAAACACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTC ACAGAACTTTT ACACAGCTGGAAATG TACGTGA TATCGCGA                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD066546             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CCAGATCTCTTTGTTCAATTACTTAAAGATTGATGGTCACCTACTCCTGATAGTACACCTAAATTTGAACATATTATGGCTCGACTTAGATCATGCAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD191866             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTGTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAGGAA TTGTATAATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT]


>consensus_8623#0 ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGT CACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGT TAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGC GTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAG CTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGT TAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACA TGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGA TCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAAT CATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANA GGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCAC AACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGAT TTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAG ATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATT ATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCT GGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCAT GCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATT GGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTAT CATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAA TGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCC ATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTATATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATT TTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAA CTGCTCAACCTAAACCTCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)