These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8634#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1128 fasta sequence [GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT] [+] EMBL CD192614 [GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTT ] [+] EMBL CD117061 [ TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC ] [+] EMBL CD117078 [ TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC ] [+] EMBL CD117923 [ TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTNTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAG ] [+] EMBL CD117851 [ TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGTAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTACGACCAGCATTAGTTA ] [+] EMBL CD117833 [ AATAAAACAGAAATGAGAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAA ] [+] EMBL CD117809 [ GTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||