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Schistosoma mansoni
cluster # 8634 cluster # 8634       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8634#0 length = 1128 sequences # 7  

consensusID : consensus_8634#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1128
fasta sequence
                              [GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT]

[+] EMBL CD192614             [GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAATTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCAGCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTGACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD117061             [                                                                                                                                                                                                              TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD117078             [                                                                                                                                                                                                              TTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTACACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAATTTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGGTTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTATCTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD117923             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTNTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD117851             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGTAGCATTTGCTATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACATTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTACGACCAGCATTAGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD117833             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATAAAACAGAAATGAGAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATGATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATTGTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGATCATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCAGCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAA                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD117809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTGGTGAACAAAATATGGTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGAATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTATTATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGATAAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGACTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT]


>consensus_8634#0 GATGCTGATGATTATAATGAAAATGATATTGAAAATACCGGATTCAATGAAACCAATAAA TTAAAGGATATTAAACTTAATCTCACTGTACCAGACACTATAACAAGTTGGAGAGCATCA GCTTATTGTACAACAAAAGAGAATGGTCTATGGATTGGTGAACCACAAATTTTAACTGTG ACTATGCCATTTTATACAGAGATAACTTTACCAAAAGAAATGAAACGTGGTGAGATTCTA CACATCCCCATAAGTGTATTTGTTTTAGATAGAAAATATTTAAATCCCACCGATGACAAT TTCAATAAAACAGAATGTTATGAAACTTCTGTTAGAATACAAGTAAATAATAGTGAATGG TTAATAACTACATCAAATGAATTTACTAATTGTCTGTGTTCTGGTCAAAAGATCACTTAT CTAGTTGGTTTATTACCACAACAATTAGGTCAATTAAATGTTACTGTTGAAGCATTTGCT ATTAGAAATAGTGAATTTTGTGGACTCATTCAAACAAATGATAATGGTAATAGTTTGACA TTTGAATCAAATAAAACAGAAATGAAAACTAATCAATCGAAATTATTATCCGATAAAATG ATTCGTCAAATCAATGTAATACCTGAAGGTATTCAACAAGAAACAACTCTTAGTGATATT GTTTGTTTAAATGAACAACAAACTACATCAACGCGTCATTTTCAATTTACTTTACCTGAT CATATTATAAAAGATTCATTTCATAGTTATATATCATATAGTGATGAAGTGTTAGGACCA GCATTAGTTAATTTAGATAGCCTTATACGTTTACCAACTGGTTGTGGTGAACAAAATATG GTATTAGTAGCACCAAATGTCTATATATTAGATTATTTAAAATCTACACCAAATATTGGA ATAAATGACAATAAAGAGAAATATATAGAATCAGCTAAATCTCACATTATACCCGGTTAT TATCAACAAATGAAATATCGTCGAGATGATGGATCATTTTCTGCATTCGGTAAATCTGAT AAAGAAGGAAGTACATGGTTAACAGCATTTGTACTACGTGTATTTGCTAAAGCTTACAGA CTACAACCGAATTTAAGCATTGATTGGAATAATTTATTTAACGGTGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)