Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8647 cluster # 8647       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8647#0 length = 651 sequences # 7  

consensusID : consensus_8647#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 651
fasta sequence
                              [CTAATG-ACCCCTCAT-GGCTCG-AGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGGGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCCAGTTCCTTCTGATTCTTTTGATAATAATGATATTCATAACTCTACTACTTCATCCTTCCGTAATTTGAAGTTTGAATCTAGTACTTATTCAA]

[+] EMBL CD060766             [CTAATG ACCCCTCAT GGCTCG AGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAAACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCT                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD061061             [  tATGAACCACTCATAGGTACGCAGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGGGTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD061078             [                                    AATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAATCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAACTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGGGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCC                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD120923             [                                                                                                                                                      TATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD121121             [                                                                                                                                                      TATGCTTACCGGACTTGGCAGTTGTGTGTGCTACTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGGAGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTCAACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATCGCATTAGACTTTTACC                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD112249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTTCATCGCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATGGGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATCGATCCAGAGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCC                                                                                            ]
[+] EMBL CD182167             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAAAACTTCCTGTAGTACACCCAGTTCCTTCTGATTCTTTTGATAATAATGATATTCATAACTCTACTACTTCATCCTTCCGTAATTTGAAGTTTGAATCTAGTACTTATTCAA]


>consensus_8647#0 CTAATGACCCCTCATGGCTCGAGGGTGTGATTTAATTGCAGGTTTAATGTTTCTGGCTAA TCTAACGAAAGTTCGTGAAAAAAACGAATTTATCTAGTCTTCTTGTCGGTCTACCTCAAA CTGTTTGGCCCAGACTTGCCCAGTTGTTATGCTTACCGGATTTGGCAGTTGTGTGTGCTA CTTTAGAGGCTCTTCGTTGCTTAACAAATCTGGATGCAACGATGTGCTTAACTTGCTGGG AGTCCTGTTGCTTAAATGTAAATTCATTCGATCAAGAAAACATTCCTTTTATTTTACTTC AACCTTTGTTAGCATTACTTACATTAGAAGGCCAGGCGATGGGTTCTCAATCGCTTCATC GCATTAGACTTTTACCCCGCACTCCACAAGCTCAAAATGTTCAACCACAACCTCCTCATG GGGCCGGTCTACGAATTCCTGCTCTTAGTCGTGTGTCTCCTAATGTAAATGAGCTCAATC GATCCAGGGATGCACCTGCATACACTAATGGGCAGATGTTAAAGTCATCTTTACGCCCAA AACTTCCTGTAGTACACCCAGTTCCTTCTGATTCTTTTGATAATAATGATATTCATAACT CTACTACTTCATCCTTCCGTAATTTGAAGTTTGAATCTAGTACTTATTCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)