Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8684 cluster # 8684       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8684#0 length = 867 sequences # 7  
consensusID : consensus_8684#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 867
fasta sequence 
                              [GTGTGAATGGTAATCTAGTTAAGTAAGTTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCA-CCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATTCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGTAATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCAAAGCTTTAATCCAGAACACAGGGTCGAAC]

[+] EMBL CD115346             [GTGTGAATGGTAATCTAGTTAAGTAAGTTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCA CCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATTCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD189088             [                           TTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCATCGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGCACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCACCCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTCCGATCCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGATGTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD061439             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGTTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTGGTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGGTGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD190147             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAA                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD190202             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAA                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD189269             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGAACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGGAAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGGCACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGTAATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCA                             ]
[-] EMBL CD115144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGAAGAGGATGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGGTTTTGAACCAGCATTACTATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTGTTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGT ATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTTAAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCAAAGCTTTAATCCAGAACACAGGGTCGAAC]




>consensus_8684#0
GTGTGAATGGTAATCTAGTTAAGTAAGTTCGACCAGGAGGGGGAGTTAATTCACGATCAT
CGTCTATGTGAGAACGAACGGGAATTGGATAAGGTACATGAGGCCGACCAGAGGCATCGC
ACACGTTATTCAGATTCCAAGGAAGATGGTTCACCACCGTTGAATATGCATCATTCTCTC
CGATTCTTTAGGTTTTGGTGGGAGATAAATAGTGCACTGATCGTTAGTATCCAATGCGAT
GTTAGCTGTTGTTGTAATGGGGGGAATAGTACAATTTGCTGACAGTGCAGAAGCATCACG
TTTACATCCAGTTGCAATTGGACCAAGTGGTTCTGTGAAAACTGGTAGATCTATATCCTG
GTTTCCATTTGAACGTGAATGACGAGGCATAGTGACGATTACAGGTGTAATGATATTTGA
ACAGTGATCTCCAGAGCTCAATTGATGACGACTTTGATTGTCAACACTTCGACCAGTTGG
AAATAATGTAAAATTAGAATGGGTCAGTGACTGTTTGGGACTCAGTGCTCTTCTGATCGG
CACAGACAATCCAAAAGCTTGTGCAAAATGTTGGGTTTGAGCAGATTGAGTAGAAGAGGA
TGGACAATAATCACCAGTGACTGCAAACCATTGTAAAGCAGGATTTTGAACCAGCATTAC
TATTGACAACTAGCGAAAGTTGAGGGCCCCATGACAGGAACATGGAAACAACCAACGCTG
TTGAGAGAAATAATGTCCAGCATGAACAGTTCAGTAATCAACTGAGGTAGTCCTCATTTT
AAAAATTGATGAGATTATGTCTTCTCGATCACAATGTAGTTAATACTTGCAAAAAGCAAA
GCTTTAATCCAGAACACAGGGTCGAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)