These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8703#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 847 fasta sequence [CACGTACCCGGACCTTGTAACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA-CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAATGATACCAGTTCAGATTCGGAACTTGACGATAATGCTTCTTCACCAATCGAAAATATATCAACTTTTATATCACTCGTTCTGGGACTGTTTGCAGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTTGGAAGTTTGTCATCTGGTGAAAGAGTATCCCTTTCTAAGTCTCTTTTTCGTTTTGTTCTTTTCCATTTTATCATACTTTCCGGGGCAATTAATCCTTCTCGACTGACAAGTCTGTTGGGATGGCTTTGTTGGTTCGGTATTCTTGGTGTGTTGCACATGTTAACATCTGTGGCTTCTTCCAGATGTAACCAAATGTCGGCTTCTGGTGCCGTCAACATGCGTCAGTGGGTGCGGATGTACTGTATGTTTATAATCATTTCTTTTGCAAATTGGTACTTGCTTAAAGCCGGTTTGGAAAACTGTT] [+] EMBL CD162474 [CACGTACCCGGACCTTGTAACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAATGATACCAGTTCAGATTCGGAACTTGACGATAATGCTTCTTCACCAATCGAAAATATATCAACTTTTATATCACTCGTTCTGGGACTGTTTGCAGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTT ] [-] EMBL CD189098 [ ACTTTCAGAGGACATTGGGACATACTGAAATCTGT GTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTAT ] [+] EMBL CD201568 [ GGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCCCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTATCAAA ] [-] EMBL CD190279 [ GGGACATACTGAAATCTGTGTGCGTTACCTATCTATGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTTGTA CTGTAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATAGTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTAT ] [+] EMBL CD133508 [ GTGCGTTACCTATCTCTGCTGCGAAGATTATTTCCGCTGATCTAACATTGCAAGTATACTTGCTACATGTCGCTCAACGCCTGACTAAAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTCGTA CTGAAATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTACTTGAGTCCATACTCCATCCTGAAGAAAATTCAGAAACGCTGGAAGTGTTGGCATTA ] [-] EMBL CD161624 [ AAAGAGTTGTGATATTCAGGAGTGAAGTGGAAATTGAATCGTATTGGGCCTTTGAAACAACAGGAATAACGAATGATAGTTCATAAGTTAACTGTGTGTTGCAGACGGTTCTATCGAATTGCTGAGAGTGTCGTGATGTGGCTTTTTGGTACCTGACATTTGCTTATTTTTGTCAGTTTCCGCCATTCTTTCAGCGTTTTGTGTCCTTGAGTCCAT ] [-] EMBL CD189575 [ AGTTCTTTTGGTTCTCTGGAAAGTAGCTGTGGTTATGTTTTTTGGAAGTTTGTCATCTGGTGAAAGAGTATCCCTTTCTAAGTCTCTTTTTCGTTTTGTTCTTTTCCATTTTATCATACTTTCCGGGGCAATTAATCCTTCTCGACTGACAAGTCTGTTGGGATGGCTTTGTTGGTTCGGTATTCTTGGTGTGTTGCACATGTTAACATCTGTGGCTTCTTCCAGATGTAACCAAATGTCGGCTTCTGGTGCCGTCAACATGCGTCAGTGGGTGCGGATGTACTGTATGTTTATAATCATTTCTTTTGCAAATTGGTACTTGCTTAAAGCCGGTTTGGAAAACTGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||