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Schistosoma mansoni
cluster # 8730 cluster # 8730       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8730#0 length = 664 sequences # 7  
consensusID : consensus_8730#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 664
fasta sequence 
                              [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT-CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTAAACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCAT-AAAAACCTCAATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGTTTTCTACACTTCTAGTATCAGNTCATTA]

[+] EMBL CD088619             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTAAAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTANACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGANATCAGGTCGCATAAAAAACCTC ATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGNTNTCTACAC NCTAGTATCAGNTCATTA]
[+] EMBL CD088648             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCGTATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAGCAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTANACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCAT AAAAACCTCAATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGTTTTCTACACTTCTAGTATCAGNTC    ]
[+] EMBL CD088657             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATCATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTAAACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCAT AAAAACCTCAATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGTTTTCTACACTTCTAGTATCAGNTC    ]
[+] EMBL CD088715             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTAAACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCAT AAAAACCTCAATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGT                            ]
[+] EMBL CD088637             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGCTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACC                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD088623             [CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGGAAGTATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCACAATTCACTGATTGATATGGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTTCCAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATAT                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD088612             [                                                                                                                                                                                 CTTTAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGTGGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAGGTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATCAAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTT CAGAACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTTCTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTAAACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCAT AAAAACCTCAACAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGTTTTCTACACTTCTAGTATCAGTTCA   ]




>consensus_8730#0
CAAACCACTTATACCTGTCAATCTAAGTAGCCTATACCACAGTAACATCAATAGGAAAGT
ATATGAAGTAATTATTATTTGATTATTATCGCATAATCAGCAAAATTCACTGATTGATAT
GGGTAACAGTAACCAAATTCATGCTTCATATTTTCACATGTTTGATTAGATGTTTGCCTT
TAACCGTGAACCGATATCAGTCTGTGAATGATTAAATACCATTGTGGTGTGGGCTATGGT
GGTCAACAGATATAAGTAGTATAAATCATCAATCGAGAGTGAAATGTCTGGTGGCAAAAG
GTTAAGAAGATTTAAGAGAAGAGAACAGAGAATGATTGGTGTGGAAATGAAGGAACAATC
AAGTCCAAGACAATTGATTAACATTTTGCAAATGAAGAATTTACTGCATGGTTTTTCAGA
ACTTACCAAGAGACTCTGCAATATTGTATTTAGACATATTTGATTGCCCATGCCCATGTT
CTCCTTCACTACATCAGGGATTATTATACAGGTATTTCACTTAAGTTTCTACCTCATTAA
ACAATATGTACTCTGGATTTCATACTTCATTCTCATTAATGAAATCAGGTCGCATAAAAA
CCTCAATAGATTTCAATAGCTACATTATAATCCAGTTTTCTACACTTCTAGTATCAGNTC
ATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)