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Schistosoma mansoni
cluster # 8732 cluster # 8732       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8732#0 length = 1378 sequences # 7  

consensusID : consensus_8732#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1378
fasta sequence
                              [TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT-CGAGATTTACCTGTATCTTCAG-TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC-TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT-T-CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT]

[+] EMBL CD081918             [TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACGTAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTTCAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAAGATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAGAGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCGGTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAGATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAACCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD117708             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCACCGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACATTAAAGCGAATTAGGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCACTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCACGTGTAATAATTGATGGTGTACTTGCGAGATTTACCTGTATCTTCAGNTTGAAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD094595             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTGCCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACGCACGGATGTATATATCTCATTTGC                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD094479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAGAATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTTATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCGGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD095379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTGTAGTAATTGATGGTGTACTT CGAGATTTACCTGTATCTTCAG TTGAAGTCAAAAACTATATCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTCACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCC TTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATCTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTC                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD157028             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCACGTTNTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACA TGCCTTTGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCAGTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAGATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAAATGTTATGCACGTG TTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTTATAAT ATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCT                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD064623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAATTGGATACAGAGGAGTGCTACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTT T CACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATATATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATTCTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTGATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATAAAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT]


>consensus_8732#0 TGTGATTTGTTGCATGAGCCAGTCGTTTTTATTTGATTTACTGAGTGCCTACGTTATACG TAATGGTGAAGTTCGATGTTCTTCTTACTTTCGGTGAATGGATGCGTCTGGGGAAACTTT CAGAGAGCATCAATCATCTGCAGATTAACCTACAAACTCCTGGATGTCTATTGTACACAA GATATGGCAGTGTTCCTTTCCTTCCTCCAGACGTTTATGAAAAAATAGAGCTATTACCAG AGTTTTCTTTCGCTTGCATGGGTTACGTGGCTGAACGCAGGTTTGCTCTGACGAAGTTCG GTGGTGGTATTGTCAAATTTGCTGGTTTAGGGAAACGTGGTGCGGTCCTATTTCAGTCAG ATCCAACTCACTTAGCGATTGTAGCAGCTGTTGATAAATCTTCTGTCCCAGTTTGGACAA CCGGTGGACGATTGCAGTTGTCAATCGGGGAATATTATAAATGCAGTAAGGTTGCGTCAC CGATAGTATACCAATCGCCAACCGACAACGAAACTTTCCTGTTAGATGTGAATCCAACAT TAAAGCGAATTANGAGTTCCGTCGTCCGAACTTCAGGGTACTTGAAGAAGTTAGCTTCAG AATGTATATCTCATGAGGAGTTGGCAAAACGGTCGGTACTTGCATCCATCGCGGGTGGTT ATGATCTACAGCTTCGTCTTCAGTCAGTTGCTGAAACAGATTTCTCACTTTGTTCAGGTG TAGTAATTGATGGTGTACTTCGAGATTTACCTGTATCTTCAGTTGAAGTCAAAAACTATA TCGATGAAAACAAAGGTTTACAAGAATTCCTAACCACTACTTTGCCCAAAGTATTTGCTC ACATTCCACCTCATCTCCCACGTTTTATTACTCAAATATGGCAACCATATGACATTGCCT TGGCAGCTCGTTCAGGATGTGACATATTTGATGGTAGTTTGCCATACCGACTCAGTCGCA GTGGGATTGGTTGGATTTACGAAGACTGGAACGAAACTAACCCCTCTAGTATGGTTTCAG ATCCAAAATTCTTAGAGTTTCCATTTGAAGAATCCTATAAATTGGATACAGAGGAGTGCT ACTTACCGATTCAACATGGATGTAATTGTTTCACGTGTTTGCATCACACACGGATGTATA TATCTCATTTGCATATTGCTCAAGAAATGTTGGCTCCTATGTTACTAATGATCCACAATT CTCATCAATATTATCGCTTTTTCTCTGATCTTCGTCGGTCTATAGCAGTAAACAAAATTG ATTCATTTATTACTCATGTCTCTAACTGGCGTTTTCCTCTTAACATTCTAACTGTTGATA AAACAAATGAGTTCTCAAAAGCACAGTAAATACAGACTATGATGACGTGTAAATCTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)