These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8758#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 726 fasta sequence [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT-AGATG-TATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC] [+] EMBL CD143571 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTAATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTTNAGATG TATGT ] [+] EMBL CD143468 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAAT ] [+] EMBL CD143561 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGCTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTCGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAA ] [+] EMBL CD143465 [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAG TTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACT ] [-] EMBL CD143433 [ TTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATCTAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC] [-] EMBL CD143550 [ AAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGGAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC] [-] EMBL CD143466 [ ATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAGTGATCATTATCACTATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGCTTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||