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Schistosoma mansoni
cluster # 8758 cluster # 8758       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8758#0 length = 726 sequences # 7  

consensusID : consensus_8758#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 726
fasta sequence
                              [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT-AGATG-TATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]

[+] EMBL CD143571             [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTAATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTTNAGATG TATGT                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD143468             [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAAT                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD143561             [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGCTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTCTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTCGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTNTACTTTACTAA                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD143465             [ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGTATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTTCTTGTCAAG TTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCAATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACT                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD143433             [                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATCTAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
[-] EMBL CD143550             [                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGTCTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGGAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]
[-] EMBL CD143466             [                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCTTTAGTGATCATTATCACTATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTTTTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCATTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTATACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTT AGATGTTATGCTTTAACCTTTTTGATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTATACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGTTTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTCTTACTC]


>consensus_8758#0 ACGATAATGTACACTATGACTTATATATGCATACTTATAGGTGCTAAATTTTTGTTTTGT ATTTGTTTCGTATGGTTACAATGAAATAAGAATGCATGCATCTCAATTCTTTCTTTCTTT CTTGTCAAGTTTTCCTATGATAAATATCAATGAAAACAGGTCAGGTGATTATTTGGACCA ATGAATATTATAATGAGTCTAAATAATAGAAGCTCTTCGTTTTTCTGTACCTTTCTTTCT TTCTTTCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCTCCAGCACATTCATTGTGCACCTCATATATTCT TTAATGATCATTATCACAATTGGTTTATAATTATGATCTTGTGTATCATCAAAATGTGTT TTAATGAATCATTGATATGTGTTTGTTTATTGTGCCTGATAGTGTTGAATTAATGAACCA TTATTATTGAATAAGTAGTATGTGATAGCAGCTATATGTTGATGAAGATGATGATGTGTA TACATTAATGTTAGTAGTTTTACTTTACTAATCACTTAGATGTATGTCTTAACCTTTTTG ATCATATAAAAAGGAAAGAATGTAATGAACTATCCATCCAGTTAACTACTAATATCGTTA TACATATATGTATGTATGAGTCGAATAATCGTGTGCTGTATTTTTTTTTCTCTCCAATGT TTCTATTCTTTGGTTGTTTTTGAAAAGATGCAGTCCTATATCTTGTCTTTTGTTTATCTC TTACTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)