These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8764#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 954 fasta sequence [CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA-CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT] [+] EMBL AI976205 [CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTACCTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTATCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTCGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCTAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTNTGTTTAACTTGTAATTAT ] [+] EMBL BF936697 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTG ] [+] EMBL BF936485 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAGTTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATT ] [+] EMBL AI976607 [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATTTACCACCATATAAATTAATAATCTTA ] [+] EMBL CD069699 [ AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCGGCTGTTGCTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCACAAACTTATTATT] [+] EMBL CD069653 [ AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAACCTTATTATT] [+] EMBL CD069641 [ AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATGGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||