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Schistosoma mansoni
cluster # 8766 cluster # 8766       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8766#0 length = 977 sequences # 7  

consensusID : consensus_8766#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 977
fasta sequence
                              [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT-CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC]

[+] EMBL CD085529             [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACTCCTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTCTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTCTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAACTTGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTNTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGNTCTTC AACCAA TGATTGCTT ACATTATCAGCTTGCTGATTCGNTGACACC TCGACTAGCTTAAATTTAcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD085431             [CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTATACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGTAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD085403             [ ATTCTTTCGAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAGCTCTATGCGATTTTGCAACTCAAGGTACACTTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAGCGATGCTA CGTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD132524             [                                                                     gAACTCAAGG ACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD117490             [                                                                                                                   ACGTATGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTATTTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD117791             [                                                                                                                                                                                                                                      ATGAGAGCTCTTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACT CTACCACCAGAGACACATATGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTGTGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCACATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD063367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGCTTTATCCCAACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTTCTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTAGCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATACATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACTTCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACATTGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCCCGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAGTACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTACGTAATATGCGTTTGGAC]


>consensus_8766#0 CATTCTTTCAAAAACTATTGGAGGGTATTAATCCACCTGATGAAATGTTTAAAACTCTAT ACGATTTTGCAACTCAAGGTACACCTTCTCAACGTAAACTATTAGATGGAATTTTACGTA TGTTAGCTGATGAAGTTTCACGTCATTTACAAGATTATCCTGAAACGATGCTACCTTTAT TTGCTGACTTGTATGGTAGTGTTCTTGCCGCTAGTACACATCTCTTTTCTATGAGAGCTC TTTCAATGCTATGGCGTTCCGTGTTAGCTCGATTATTCACTCTACCACCAGAGACACATA TGGATTCAACGTTGTTTCGTGCTATGATTCATATTCTAATGAAGGCTAAAAACACGTTTG TGCACTTTTCTAATCTTCCAAATTGTTTAGCCAGTTGTCCAGTCTTCAAAGCGTTTCCAC ATGACCTTCAAGGATACATTTTAAACTCTGAATTAGCCGTCAAGAATTACGCATTATCCC AACAAACTACTGCATCCTTGTCGAAGAATTTGACAACTACCGGGAGTAATGGAGGTGGTT CTTCAAACCAATTGATTGCTTCACATTATCAGCTTGCTGATTCGTTGACACCATCGACTA GCTTAAATTTAACCATGCCTACTTCAAATATTGTCGGCAGCGGTGGTGTTGCTGCTGATA CATCATCATGCATCAAGGCACCTGATGCACCAGAGGAAAGCATTTCCGATCGTGTCTACT TCTTATTTAATAATGTATCAAAAGTGAATGCTAAAGAAAAATCAAATGAATTAGCCACAT TGTTATCAAAAGATCGACTTATACCATGGTTTGCCTTTTATCTTGTCAGTAAACGTATCC CGGTTGAACAAACATTTCACGATCTCTTCGCTTTGGTACTTGATCATATTCAAGAAAGAG TACCAAATGTTAGACCTAAAGTTATGTACGAACTTATCAGACATATCAAGTTTATTCTAC GTAATATGCGTTTGGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)