Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8779 cluster # 8779       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8779#0 length = 1613 sequences # 7  

consensusID : consensus_8779#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1613
fasta sequence
                              [TCCTTCCTTATCAAGCATCATTCGTGAGTAAAATCCAAACGCATATGGGAATGGTTGAGATTAACGATGGTCGCCATTTTAAAAATCCCTTCCAGGATTATACCGCCGGAGACCAGCTTAAAGTGGAGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG-AATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTCGAATGGTATAATGAATGCTATCTTGGGGCTGCGCATGG-TTTTGC-GGTAATTTGACTACTCTACTGAAGGTATATCGTTTGTTTCCTGGTAGCATATCGTCACATTCCTTAAATCAGTTAATTCTACCTACTGTTGATTGGATGAGTCAACTTCAGCTAAACAGCGGAAATTGGCCTTCTAGTTTAGGGGATAGCTTAAATCGTGATGTATTAGTTCATTGGTGTCATGGTGCAACGGGGTGTTATCCCACTTATGCTTTCAGCTCATAAGATTACAGGTGAAAATAAATATTTAAAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA-CTCGTGGTCTACTTCACAAA-GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTTTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTTTATAGAG]

[+] EMBL CD064296             [TCCTTCCTTATCAAGCATCATTCGTGAGTAAAATCCAAACGCATATGGGAATGGTTGAGATTAACGATGGTCGCCATTTTAAAAATCCCTTCCAGGATTATACCGCCGGAGACCAGCTTAAAGTGGAGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD096212             [                                                                                                                              AGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATCTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGNCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGNTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD096286             [                                                                                                                              AGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGAATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGACTATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAAATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGAAGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTCTATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAATAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGCAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTGCGACATTCCTATTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI977752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGGAAGCGAG AATACAGAGGCGAAGAAATTTGTTGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCTTAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAAAATAATTTCGACATCCCTGTCTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCCGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTCGAATGGTATAATGAATGCTATCTTGGGGCTGCGCATGGTTTTTGC GGTAATTTGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BF936620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAGAAATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATTTTGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATGGGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTATTTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGGTCAGAAAACAGCTGGTGCTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGCGCATGCCACCGTTAATGTTTGAATGGCATGATATATGTTATCTTGGGGCTGCGCATGG TTTTGCTGGTATTTTGACTACTCTACTGAAGGTATATCGTTTGTTTCCTGGTAGCATATCGTCACATTCCTTAAATCAGTTAATTCTACCTACTGTTGATTGGATGAGTCAACTTCAGCTAAACAGCGGAAATTGGCCTTCTAGTTTAGGGGATAGCTTAAATCGTGATGTATTAGTTCATTGGTGTCATGGTGCAACGGGGTGTTATCCCACTTATGCTTTCAGCTCATAAGATTACAGGTGAAAATAAATATTTAAAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGACCTCGTGGTCTACTTCACAAAGGGCTGTGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD074947             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAAAATAAATATTT AAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA CTCGTGGTCTACTTCACAAA GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTTTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTTTATAGAG]
[+] EMBL CD081125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGA CTCGTGGTCTACTT ACAAA GGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAGATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGGTGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAAGGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTTCCTCTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAACTAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAAAAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAAGTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATATCACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTCTATAGAG]


>consensus_8779#0 TCCTTCCTTATCAAGCATCATTCGTGAGTAAAATCCAAACGCATATGGGAATGGTTGAGA TTAACGATGGTCGCCATTTTAAAAATCCCTTCCAGGATTATACCGCCGGAGACCAGCTTA AAGTGGAGAATACGAGCATCCCGAACAAAATTGTCGAACTGTTAAATGTTCTGAATTCGA ATTTCGAGAAGCTATCGTCGTCTGACGTTTCAATGTATACGGGGTTGTCAGGTGTTGGAC TATTCTACAATTTCCTATCGCAATGCAAATGTGAATTATTAGACAGAAAGATACGTGAAA ATGGTGTTGCATGTACCGAAAAGTTGCTAAATCGATGTCTACGTCATATTGAATTGAAGA AGTTGTCTAGAAACATCAGTGTTTACACCAGCCCGATCGGTCCACTGTGTTTAGGCGCTC TATCATCGGTCAAACATGGAAGCGAGAATACAGAGGCGAAGAAATTCGTAGAAGAAATTT TGTCGGCGAGTAAATATGGCATAGATGTGGACAGTGGGATGCCTGATGAAGCGTTGTATG GGCGTACTGGCTATCTAAATTGTCTGGTAACACTTCGAGAGAATAATTTCGACATTCCTA TTTCTGTTGTCTCGTCGATAACAGATGCTATATTGAAGTCTGGTCAGAAAACAGCTGGTG CTTACAAATCGAATGGTTTTTATGATAGATTAATGTATCAGTCATCGAAACGAGATTTGC GCATGCCACCGTTAATGTTCGAATGGTATAATGAATGCTATCTTGGGGCTGCGCATGGTT TTGCGGTAATTTGACTACTCTACTGAAGGTATATCGTTTGTTTCCTGGTAGCATATCGTC ACATTCCTTAAATCAGTTAATTCTACCTACTGTTGATTGGATGAGTCAACTTCAGCTAAA CAGCGGAAATTGGCCTTCTAGTTTAGGGGATAGCTTAAATCGTGATGTATTAGTTCATTG GTGTCATGGTGCAACGGGGTGTTATCCCACTTATGCTTTCAGCTCATAAGATTACAGGTG AAAATAAATATTTAAAAGTGTGCATTAGACGGAGGAGAAGCTGTATGGACTCGTGGTCTA CTTCACAAAGGCTGTGGTTTATGTCATGGTTCAGCTGGTAGTGGTTTCGCTCTATTAGAG ATTTATCAAACAACTCAAGATCCCAAATATTTGTATAGAGCTATAAAGTTCGCTGAATGG TGCACCGACTATTCTAAAAATGCTACTCGCATTGCTGATCGTCCGTACTCACTTATGGAA GGTCTTGCTGGGACATTGTACTTCCTTGTTGGTATTTTGGATCCAGTTCATGCGAAGTTT CCTTTACTAAGTGGATTGTGAATAGAAAGGAACCATAATTGTATTTATTATTTATTCAAC TAACTTTATCTAATTATTTTGTACTGACATATCCTATCTTGGATAAACTATCATACTGAA AAAAAACAAAAACGACTATATTGCATAATCATCACATTGAATTTTTAAGAGAAACCAGAA GTAATATTGAATATAAACTACAGTGAATAAAAGAATGTATTTTTTTTTATCCCATCATAT CACCTTCACTTTCTTTTGTAATGGAATGCGTTAGGAACAAGTTTTTTATAGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)