These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8797#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1072 fasta sequence [TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT-AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC] [+] EMBL AI395526 [TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGGAAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCCATTGAGTTCCAAGGCGATTGGTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATAa ] [+] EMBL SMT14512 [ AGCATTTTTNAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTAATCTTTNATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGANCAAATAANCTGACCACATTATCTAAATNCTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGNGT AAAAAANAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAGGGAAATAGGTTTCCTAGAA ] [+] EMBL CD077057 [ CTTTCATCCTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGTAAAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGAAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGATTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAAACGTAGCATA ] [-] EMBL CD084331 [ GATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTT ] [+] EMBL CD182796 [ AGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGNGGTTTTCATTATCATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGT ] [+] EMBL CD062738 [ TTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC] [-] EMBL CD062742 [ TTCTTTGATTAGCTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTAGTACGATTTTTCTGTGTATCTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||