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Schistosoma mansoni
cluster # 8797 cluster # 8797       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8797#0 length = 1072 sequences # 7  

consensusID : consensus_8797#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1072
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT-AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC]

[+] EMBL AI395526             [TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACAAATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGT AAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGGAAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCCATTGAGTTCCAAGGCGATTGGTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL SMT14512             [                                                AGCATTTTTNAAATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTTTTAATCTTTNATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGANCAAATAANCTGACCACATTATCTAAATNCTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGNGT AAAAAANAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAGGGAAATAGGTTTCCTAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD077057             [                                                                                                                                                                                                              CTTTCATCCTCCTCTGTAACTATAACATACATGACATAATGAGTAAAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAGAACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGAAATGATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGATTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGTGGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAAACGTAGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD084331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GATAATAAAATATAATCTGTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTGAATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGTTTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCAAAGCTGCTTCAACAGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD182796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACACTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGNGGTTTTCATTATCATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGGAACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD062738             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTGTATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTTGTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCACCTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATTGAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC]
[-] EMBL CD062742             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCTTTGATTAGCTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACGTAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTAGTACGATTTTTCTGTGTATCTGA                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_8797#0 TTTTTTTTTTTTTTTNTGAAAAAAGAAAACTGCAATATTATTACCATAAGCATTTTTGAA ATGCGCAAATATCTACGCCAACAAAATTGAATATATGACCAAGATAGGGTTCGGTCCTTT TTTATCTTTTATGTGTTATGTTTTGAAAAAATATCGCTAACTTTCAAAATAGTTTGAACA AATAAACTGACCACATTATCTAAATACTTTCATACTCCTCTGTAACTATAACATACATGA CATAATGAGTAAAAAAAAAGAGTAAACTACACAAACAAAAGAAGGAAATAAGTTTCCTAG AACAATAATATTAATGATAACAATGACAATAATAATGGGAATGATAATAAAATATAATCT GTAATAATGATATTTCGATTGAGTTCGAAGGCGATTGTTTAATGAATAGATGAGTAAGTG AATAAACAAATTATATTAGGCATATAGAATAAACTGGTAATTATATGTCTTATGTTTAGT TTGGAAGTGGATTCCCTTCAATCTGTTGTTGTATAGTGTCAGATAATGCTGCTCTTTGCA AAGCTGCTTCAACAGCTTTTCGTCGAGCGATAATTGACTCGTTTACTTTGTTTCGAGACA CTGTATTTTCACGAGTACTGGGTTTACTAATGGTTAGATGCTTAAGATCATCTTCATCGT GGTTTTCATTATTATGTTCTGATGAACGACCTTGCTGATTGGAACTACATTGCGAAATGG AACATTGATTTCTTTGATTAACTGGAGCATTCGTAGTGCGATTAGTAGAAGTAGTAGACG TAGCATAAGTTGCAGCAGCTGAAGGTTTAGGTCGACTGCGAGTACTACGATTATTCTGTG TATCTGAAGCAGTCCCAACTACAGAACTCTGAGTGGTTATCTGATTTCTATTGGTTGTTT GTGAACCTTGTCTGGAGTTCGATGGACGATGCTGTTCTTGAACATTTGAAGTTGATGCAC CTGGACGTGGACGAACAGCTCGTATAGGCGTCGGTTTCGAAGTCGTCCCACTATTTGATT GAGCTCTCTGTCGCTGACGATTGCGTTCTAACCGAGCCAGTCCAGCACGAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)